DNTT

DNTT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2COE
Ідентифікатори
Символи	DNTT, TDT, DNA nucleotidylexotransferase, Terminal deoxynucleotidyl transferase
Зовнішні ІД	OMIM: 187410 MGI: 98659 HomoloGene: 3014 GeneCards: DNTT
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • nucleotidyltransferase activity; • GO:0001948 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • DNA nucleotidylexotransferase activity; • ДНК-полімераза; • DNA polymerase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Еухроматин; • nuclear matrix; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• DNA metabolic process; • DNA biosynthetic process; • DNA modification; • response to ATP; • double-strand break repair via nonhomologous end joining;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1791
	21673
	ENSG00000107447
	ENSMUSG00000025014
	P04053
	P09838
	NM_001017520; NM_004088
	NM_001043228; NM_009345
	NP_001017520; NP_004079
	NP_001036693; NP_033371
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DNTT (англ. DNA nucleotidylexotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 536[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPPRASHLS	PRKKRPRQTG	ALMASSPQDI	KFQDLVVFIL	EKKMGTTRRA
FLMELARRKG	FRVENELSDS	VTHIVAENNS	GSDVLEWLQA	QKVQVSSQPE
LLDVSWLIEC	IRAGKPVEMT	GKHQLVVRRD	YSDSTNPGPP	KTPPIAVQKI
SQYACQRRTT	LNNCNQIFTD	AFDILAENCE	FRENEDSCVT	FMRAASVLKS
LPFTIISMKD	TEGIPCLGSK	VKGIIEEIIE	DGESSEVKAV	LNDERYQSFK
LFTSVFGVGL	KTSEKWFRMG	FRTLSKVRSD	KSLKFTRMQK	AGFLYYEDLV
SCVTRAEAEA	VSVLVKEAVW	AFLPDAFVTM	TGGFRRGKKM	GHDVDFLITS
PGSTEDEEQL	LQKVMNLWEK	KGLLLYYDLV	ESTFEKLRLP	SRKVDALDHF
QKCFLIFKLP	RQRVDSDQSS	WQEGKTWKAI	RVDLVLCPYE	RRAFALLGWT
GSRQFERDLR	RYATHERKMI	LDNHALYDKT	KRIFLKAESE	EEIFAHLGLD
YIEPWERNA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

Riley L.K., Morrow J.K., Danton M.J., Coleman M.S. (1988). Human terminal deoxyribonucleotidyltransferase: molecular cloning and structural analysis of the gene and 5' flanking region.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 2489 — 2493. PubMed DOI:10.1073/pnas.85.8.2489
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Koiwai O., Morita A. (1988). Isolation of putative promoter region for human terminal deoxynucleotidyltransferase gene.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 154: 91 — 100. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(88)90654-7
Peterson R.C., Cheung L.C., Mattaliano R.J., Chang L.M.S., Bollum F.J. (1984). Molecular cloning of human terminal deoxynucleotidyltransferase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 4363 — 4367. PubMed DOI:10.1073/pnas.81.14.4363
Mahajan K.N., Mitchell B.S. (2003). Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10746 — 10751. PubMed DOI:10.1073/pnas.1631060100
Yang B., Gathy K.N., Coleman M.S. (1994). Mutational analysis of residues in the nucleotide binding domain of human terminal deoxynucleotidyl transferase.. J. Biol. Chem. 269: 11859 — 11868. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2983 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P04053 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2983 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04053 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.