EIF2AK2

EIF2AK2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3UIU, 1QU6, 2A19, 2A1A
Ідентифікатори
Символи	EIF2AK2, EIF2AK1, PKR, PPP1R83, PRKR, eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2, LEUDEN, DYT33
Зовнішні ІД	OMIM: 176871 MGI: 1353449 HomoloGene: 48134 GeneCards: EIF2AK2
шифр КФ	2.7.10.2
Реагує на сполуку
	PKR inhibitor[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • double-stranded RNA binding; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase activity; • protein phosphatase regulator activity; • RNA binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • рибосома; • мембрана; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • cytosolic ribosome;
Біологічний процес	• negative regulation of translation; • regulation of hematopoietic stem cell proliferation; • regulation of transcription, DNA-templated; • Біосинтез білків; • positive regulation of cytokine production; • immune system process; • фосфорилювання; • cellular response to amino acid starvation; • negative regulation of apoptotic process; • mitigation of host immune response by virus; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • transcription, DNA-templated; • Відповідь на незгорнуті білки; • protein phosphorylation; • negative regulation of viral genome replication; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • regulation of hematopoietic progenitor cell differentiation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • defense response to virus; • response to interferon-alpha; • positive regulation of chemokine production; • negative regulation of osteoblast proliferation; • protein autophosphorylation; • regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • Вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • response to toxic substance; • positive regulation of stress-activated MAPK cascade; • response to virus; • regulation of translational initiation by eIF2 alpha phosphorylation; • regulation of apoptotic process; • negative regulation of cell population proliferation; • regulation of phosphoprotein phosphatase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5610
	19106
	ENSG00000055332
	ENSMUSG00000024079
	P19525
	Q03963
	NM_001135651; NM_001135652; NM_002759
	NM_011163
	NP_001129123; NP_001129124; NP_002750
	NP_035293
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF2AK2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 62 094[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGDLSAGFF	MEELNTYRQK	QGVVLKYQEL	PNSGPPHDRR	FTFQVIIDGR
EFPEGEGRSK	KEAKNAAAKL	AVEILNKEKK	AVSPLLLTTT	NSSEGLSMGN
YIGLINRIAQ	KKRLTVNYEQ	CASGVHGPEG	FHYKCKMGQK	EYSIGTGSTK
QEAKQLAAKL	AYLQILSEET	SVKSDYLSSG	SFATTCESQS	NSLVTSTLAS
ESSSEGDFSA	DTSEINSNSD	SLNSSSLLMN	GLRNNQRKAK	RSLAPRFDLP
DMKETKYTVD	KRFGMDFKEI	ELIGSGGFGQ	VFKAKHRIDG	KTYVIKRVKY
NNEKAEREVK	ALAKLDHVNI	VHYNGCWDGF	DYDPETSDDS	LESSDYDPEN
SKNSSRSKTK	CLFIQMEFCD	KGTLEQWIEK	RRGEKLDKVL	ALELFEQITK
GVDYIHSKKL	IHRDLKPSNI	FLVDTKQVKI	GDFGLVTSLK	NDGKRTRSKG
TLRYMSPEQI	SSQDYGKEVD	LYALGLILAE	LLHVCDTAFE	TSKFFTDLRD
GIISDIFDKK	EKTLLQKLLS	KKPEDRPNTS	EILRTLTVWK	KSPEKNERHT
C

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, cерин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Thomis D.C., Doohan J.P., Samuel C.E. (1992). Mechanism of interferon action: cDNA structure, expression, and regulation of the interferon-induced, RNA-dependent P1/eIF-2 alpha protein kinase from human cells.. Virology 188: 33 — 46. PubMed DOI:10.1016/0042-6822(92)90732-5
Kuhen K.L., Shen X., Samuel C.E. (1996). Mechanism of interferon action sequence of the human interferon-inducible RNA-dependent protein kinase (PKR) deduced from genomic clones.. Gene 178: 191 — 193. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(96)00314-9
Xu Z., Williams B.R. (1998). Genomic features of human PKR: alternative splicing and a polymorphic CGG repeat in the 5'-untranslated region.. J. Interferon Cytokine Res. 18: 609 — 616. PubMed DOI:10.1089/jir.1998.18.609
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Polyak S.J., Tang N., Wambach M., Barber G.N., Katze M.G. (1996). The P58 cellular inhibitor complexes with the interferon-induced, double-stranded RNA-dependent protein kinase, PKR, to regulate its autophosphorylation and activity.. J. Biol. Chem. 271: 1702 — 1707. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.3.1702
Brand S.R., Kobayashi R., Mathews M.B. (1997). The Tat protein of human immunodeficiency virus type 1 is a substrate and inhibitor of the interferon-induced, virally activated protein kinase, PKR.. J. Biol. Chem. 272: 8388 — 8395. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.13.8388

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9437 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P19525 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9437 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P19525 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.