ERG

ERG
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SXE, 4IRG, 4IRH, 4IRI
Ідентифікатори
Символи	ERG, erg-3, p55, ETS-related gene, v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog, ETS transcription factor, ETS transcription factor ERG
Зовнішні ІД	OMIM: 165080 MGI: 95415 HomoloGene: 15848 GeneCards: ERG
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • regulation of transcription, DNA-templated; • endocardial cushion development; • endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation; • transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • positive regulation of blood vessel remodeling; • protein phosphorylation; • проліферація; • cell migration; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2078
	13876
	ENSG00000157554
	ENSMUSG00000040732
	P11308
	P81270
NM_001136154; NM_001136155; NM_001243428; NM_001243429; NM_001243432;
	NM_001243433; NM_001291391; NM_004449; NM_182918; NM_001331025
NM_133659; NM_001302152; NM_001302153; NM_001302154; NM_001302179;
	NM_001302183
NP_001129626; NP_001129627; NP_001230357; NP_001230358; NP_001230361;
	NP_001278320; NP_001317954; NP_004440; NP_891548
NP_001289081; NP_001289082; NP_001289083; NP_001289108; NP_001289112;
	NP_598420
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ERG (англ. ERG, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 54 608[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIQTVPDPAA	HIKEALSVVS	EDQSLFECAY	GTPHLAKTEM	TASSSSDYGQ
TSKMSPRVPQ	QDWLSQPPAR	VTIKMECNPS	QVNGSRNSPD	ECSVAKGGKM
VGSPDTVGMN	YGSYMEEKHM	PPPNMTTNER	RVIVPADPTL	WSTDHVRQWL
EWAVKEYGLP	DVNILLFQNI	DGKELCKMTK	DDFQRLTPSY	NADILLSHLH
YLRETPLPHL	TSDDVDKALQ	NSPRLMHARN	TGGAAFIFPN	TSVYPEATQR
ITTRPDLPYE	PPRRSAWTGH	GHPTPQSKAA	QPSPSTVPKT	EDQRPQLDPY
QILGPTSSRL	ANPGSGQIQL	WQFLLELLSD	SSNSSCITWE	GTNGEFKMTD
PDEVARRWGE	RKSKPNMNYD	KLSRALRYYY	DKNIMTKVHG	KRYAYKFDFH
GIAQALQPHP	PESSLYKYPS	DLPYMGSYHA	HPQKMNFVAP	HPPALPVTSS
SFFAAPNPYW	NSPTGGIYPN	TRLPTSHMPS	HLGTYY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Rao V.N., Papas T.S., Shyam E., Reddy P. (1987). erg, a human ets-related gene on chromosome 21: alternative splicing, polyadenylation, and translation.. Science 237: 635 — 639. PubMed DOI:10.1126/science.3299708
Reddy E.S.P., Rao V.N., Papas T.S. (1987). The erg gene: a human gene related to the ets oncogene.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 6131 — 6135. PubMed DOI:10.1073/pnas.84.17.6131
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Dunn T., Praissman L., Hagag N., Viola M.V. (1994). ERG gene is translocated in an Ewing's sarcoma cell line.. Cancer Genet. Cytogenet. 76: 19 — 22. PubMed DOI:10.1016/0165-4608(94)90063-9
Prasad D.D., Rao V.N., Lee L., Reddy E.S. (1994). Differentially spliced erg-3 product functions as a transcriptional activator.. Oncogene 9: 669 — 673. PubMed
Ichikawa H., Shimizu K., Hayashi Y., Ohki M. (1994). An RNA-binding protein gene, TLS/FUS, is fused to ERG in human myeloid leukemia with t(16;21) chromosomal translocation.. Cancer Res. 54: 2865 — 2868. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3446 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P11308 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3446 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P11308 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.