EXOSC10

EXOSC10
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CPR, 3SAF, 3SAG, 3SAH
Ідентифікатори
Символи	EXOSC10, PM-Scl, PM/Scl-100, PMSCL, PMSCL2, RRP6, Rrp6p, p2, p3, p4, exosome component 10
Зовнішні ІД	OMIM: 605960 MGI: 1355322 HomoloGene: 31105 GeneCards: EXOSC10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • exoribonuclease activity; • GO:0001948 protein binding; • каталітична активність; • 3'-5' exonuclease activity; • nucleic acid binding; • nuclease activity; • exonuclease activity; • hydrolase activity; • RNA binding; • 3'-5'-exoribonuclease activity; • telomerase RNA binding; • single-stranded RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Екзосома; • мембрана; • nuclear exosome (RNase complex); • внутрішньоклітинний; • Ядерце; • transcriptionally active chromatin; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• RNA processing; • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • nuclear retention of unspliced pre-mRNA at the site of transcription; • CUT catabolic process; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process; • nuclear mRNA surveillance; • cell metabolism; • maturation of 5.8S rRNA; • histone mRNA catabolic process; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • nucleobase-containing compound metabolic process; • rRNA processing; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • regulation of telomerase RNA localization to Cajal body; • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process; • nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process; • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process; • nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process; • nuclear polyadenylation-dependent antisense transcript catabolic process; • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5394
	50912
	ENSG00000171824
	ENSMUSG00000017264
	Q01780
	P56960
	NM_001001998; NM_002685
	NM_016699; NM_001355489; NM_001355490
	NP_001001998; NP_002676
	NP_057908; NP_001342418; NP_001342419
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EXOSC10 (англ. Exosome component 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 885 амінокислот, а молекулярна маса — 100 831[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPPSTREPR	VLSATSATKS	DGEMVLPGFP	DADSFVKFAL	GSVVAVTKAS
GGLPQFGDEY	DFYRSFPGFQ	AFCETQGDRL	LQCMSRVMQY	HGCRSNIKDR
SKVTELEDKF	DLLVDANDVI	LERVGILLDE	ASGVNKNQQP	VLPAGLQVPK
TVVSSWNRKA	AEYGKKAKSE	TFRLLHAKNI	IRPQLKFREK	IDNSNTPFLP
KIFIKPNAQK	PLPQALSKER	RERPQDRPED	LDVPPALADF	IHQQRTQQVE
QDMFAHPYQY	ELNHFTPADA	VLQKPQPQLY	RPIEETPCHF	ISSLDELVEL
NEKLLNCQEF	AVDLEHHSYR	SFLGLTCLMQ	ISTRTEDFII	DTLELRSDMY
ILNESLTDPA	IVKVFHGADS	DIEWLQKDFG	LYVVNMFDTH	QAARLLNLGR
HSLDHLLKLY	CNVDSNKQYQ	LADWRIRPLP	EEMLSYARDD	THYLLYIYDK
MRLEMWERGN	GQPVQLQVVW	QRSRDICLKK	FIKPIFTDES	YLELYRKQKK
HLNTQQLTAF	QLLFAWRDKT	ARREDESYGY	VLPNHMMLKI	AEELPKEPQG
IIACCNPVPP	LVRQQINEMH	LLIQQAREMP	LLKSEVAAGV	KKSGPLPSAE
RLENVLFGPH	DCSHAPPDGY	PIIPTSGSVP	VQKQASLFPD	EKEDNLLGTT
CLIATAVITL	FNEPSAEDSK	KGPLTVAQKK	AQNIMESFEN	PFRMFLPSLG
HRAPVSQAAK	FDPSTKIYEI	SNRWKLAQVQ	VQKDSKEAVK	KKAAEQTAAR
EQAKEACKAA	AEQAISVRQQ	VVLENAAKKR	ERATSDPRTT	EQKQEKKRLK
ISKKPKDPEP	PEKEFTPYDY	SQSDFKAFAG	NSKSKVSSQF	DPNKQTPSGK
KCIAAKKIKQ	SVGNKSMSFP	TGKSDRGFRY	NWPQR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

Bluethner M., Bautz F.A. (1992). Cloning and characterization of the cDNA coding for a polymyositis-scleroderma overlap syndrome-related nucleolar 100-kD protein.. J. Exp. Med. 176: 973 — 980. PubMed DOI:10.1084/jem.176.4.973
Ge Q., Frank M.B., O'Brien C., Targoff I.N. (1992). Cloning of a complementary DNA coding for the 100-kD antigenic protein of the PM-Scl autoantigen.. J. Clin. Invest. 90: 559 — 570. PubMed DOI:10.1172/JCI115895
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities.. Mol. Cell 12: 675 — 687. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6
Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation.. Genome Res. 14: 1315 — 1323. PubMed DOI:10.1101/gr.2122004
West S., Gromak N., Norbury C.J., Proudfoot N.J. (2006). Adenylation and exosome-mediated degradation of cotranscriptionally cleaved pre-messenger RNA in human cells.. Mol. Cell 21: 437 — 443. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2005.12.008

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9138 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, Q01780 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9138 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q01780 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.