EXOSC2

EXOSC2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosome component 2, SHRF
Зовнішні ІД	OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 GeneCards: EXOSC2
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• 3'-5'-exoribonuclease activity; • exoribonuclease activity; • 7S RNA binding; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Екзосома; • nuclear exosome (RNase complex); • cytoplasmic exosome (RNase complex); • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Ядерце;
Біологічний процес	• nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process; • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process; • regulation of mRNA stability; • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'; • CUT catabolic process; • nuclear retention of pre-mRNA with aberrant 3'-ends at the site of transcription; • positive regulation of cell growth; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • rRNA processing; • U4 snRNA 3'-end processing; • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23404
	227715
	ENSG00000130713
	ENSMUSG00000039356
	Q13868
	Q8VBV3
	NM_001282708; NM_001282709; NM_014285
	NM_144886
	NP_001269637; NP_001269638; NP_055100
	NP_659135
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EXOSC2 (англ. Exosome component 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 32 789[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMEMRLPVA	RKPLSERLGR	DTKKHLVVPG	DTITTDTGFM	RGHGTYMGEE
KLIASVAGSV	ERVNKLICVK	ALKTRYIGEV	GDIVVGRITE	VQQKRWKVET
NSRLDSVLLL	SSMNLPGGEL	RRRSAEDELA	MRGFLQEGDL	ISAEVQAVFS
DGAVSLHTRS	LKYGKLGQGV	LVQVSPSLVK	RQKTHFHDLP	CGASVILGNN
GFIWIYPTPE	HKEEEAGGFI	ANLEPVSLAD	REVISRLRNC	IISLVTQRMM
LYDTSILYCY	EASLPHQIKD	ILKPEIMEEI	VMETRQRLLE	QEG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

Mitchell P., Petfalski E., Shevchenko A., Mann M., Tollervey D. (1997). The exosome: a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3'-->5' exoribonucleases.. Cell 91: 457 — 466. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80432-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Mitchell P., Petfalski E., Tollervey D. (1996). The 3' end of yeast 5.8S rRNA is generated by an exonuclease processing mechanism.. Genes Dev. 10: 502 — 513. PubMed DOI:10.1101/gad.10.4.502
Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1.. Genes Dev. 19: 351 — 361. PubMed DOI:10.1101/gad.1282305
van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways.. RNA 13: 1027 — 1035. PubMed DOI:10.1261/rna.575107
Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome.. Cell 127: 1223 — 1237. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17097 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q13868 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17097 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q13868 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.