EXOSC6

EXOSC6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC6, EAP4, MTR3, Mtr3p, hMtr3p, p11, Exosome component 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606490 MGI: 1919794 HomoloGene: 12469 GeneCards: EXOSC6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• exoribonuclease activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Екзосома; • nuclear exosome (RNase complex); • cytoplasmic exosome (RNase complex); • Ядерце; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• regulation of mRNA stability; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'; • rRNA 3'-end processing; • rRNA catabolic process; • DNA deamination; • nuclear mRNA surveillance; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • U4 snRNA 3'-end processing; • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing; • rRNA processing; • positive regulation of isotype switching; • Перемикання класу імуноглобулінів; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	118460
	72544
	ENSG00000223496
	ENSMUSG00000109941
	Q5RKV6
	Q8BTW3
	NM_058219
	NM_028274
	NP_478126
	NP_082550
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EXOSC6 (англ. Exosome component 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 28 235[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGDHRRIRG	PEESQPPQLY	AADEEEAPGT	RDPTRLRPVY	ARAGLLSQAK
GSAYLEAGGT	KVLCAVSGPR	QAEGGERGGG	PAGAGGEAPA	ALRGRLLCDF
RRAPFAGRRR	RAPPGGCEER	ELALALQEAL	EPAVRLGRYP	RAQLEVSALL
LEDGGSALAA	ALTAAALALA	DAGVEMYDLV	VGCGLSLAPG	PAPTWLLDPT
RLEEERAAAG	LTVALMPVLN	QVAGLLGSGE	GGLTESWAEA	VRLGLEGCQR
LYPVLQQSLV	RAARRRGAAA	QP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як процесмнг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Raijmakers R., Vree Egberts W., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions between human exosome components support the assembly of RNase PH-type subunits into a six-membered PNPase-like ring.. J. Mol. Biol. 323: 653 — 663. PubMed DOI:10.1016/S0022-2836(02)00947-6
Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation.. Genome Res. 14: 1315 — 1323. PubMed DOI:10.1101/gr.2122004
Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome.. Cell 127: 1223 — 1237. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell 131: 188 — 189.

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19055 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q5RKV6 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19055 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q5RKV6 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.