F11R

F11R
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1NBQ, 3EOY, 3TSZ, 4ODB
Ідентифікатори
Символи	F11R, F11r, 9130004G24, AA638916, ESTM33, JAM, JAM-1, JAM-A, Jcam, Jcam1, Ly106, CD321, JAM1, JAMA, KAT, PAM-1, F11 receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605721 MGI: 1321398 HomoloGene: 14255 GeneCards: F11R
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • virus receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • bicellular tight junction; • клітинна мембрана; • slit diaphragm; • Екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • Міжклітинні контакти;
Біологічний процес	• regulation of actin cytoskeleton reorganization; • Диференціація клітин; • establishment of endothelial intestinal barrier; • epithelial cell differentiation; • actomyosin structure organization; • extracellular matrix organization; • regulation of membrane permeability; • regulation of cytokine production; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of blood pressure; • Адгезія клітин; • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity; • bicellular tight junction assembly; • viral entry into host cell; • intestinal absorption; • response to radiation; • inflammatory response; • GO:0022415 viral process; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • leukocyte migration; • protein localization to plasma membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	50848
	16456
	ENSG00000158769
	ENSMUSG00000038235
	Q9Y624
	O88792
NM_016946; NM_144501; NM_144502; NM_144503; NM_144504;
	NM_001348091; NM_001382727; NM_001382730; NM_001382733; NM_001382734
	NM_172647
NP_058642; NP_001335020; NP_001369656; NP_001369659; NP_001369662;
	NP_001369663
	NP_766235
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

F11R (англ. F11 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 32 583[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTKAQVERK	LLCLFILAIL	LCSLALGSVT	VHSSEPEVRI	PENNPVKLSC
AYSGFSSPRV	EWKFDQGDTT	RLVCYNNKIT	ASYEDRVTFL	PTGITFKSVT
REDTGTYTCM	VSEEGGNSYG	EVKVKLIVLV	PPSKPTVNIP	SSATIGNRAV
LTCSEQDGSP	PSEYTWFKDG	IVMPTNPKST	RAFSNSSYVL	NPTTGELVFD
PLSASDTGEY	SCEARNGYGT	PMTSNAVRME	AVERNVGVIV	AAVLVTLILL
GILVFGIWFA	YSRGHFDRTK	KGTSSKKVIY	SQPSARSEGE	FKQTSSFLV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Naik U.P., Ehrlich Y.H., Kornecki E. (1995). Mechanisms of platelet activation by a stimulatory antibody: cross-linking of a novel platelet receptor for monoclonal antibody F11 with the Fc gamma RII receptor.. Biochem. J. 310: 155 — 162. PubMed DOI:10.1042/bj3100155
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes.. Nat. Immunol. 3: 151 — 158. PubMed DOI:10.1038/ni755
Muller W.A. (2003). Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response.. Trends Immunol. 24: 327 — 334. PubMed DOI:10.1016/S1471-4906(03)00117-0
Fraemohs L., Koenen R.R., Ostermann G., Heinemann B., Weber C. (2004). The functional interaction of the beta 2 integrin lymphocyte function-associated antigen-1 with junctional adhesion molecule-A is mediated by the I domain.. J. Immunol. 173: 6259 — 6264. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.173.10.6259

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14685 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q9Y624 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14685 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y624 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.