FUS

FUS
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LA6, 2LCW, 4FDD, 4FQ3
Ідентифікатори
Символи	FUS, ALS6, ETM4, FUS1, HNRNPP2, POMP75, TLS, FUS RNA binding protein, altFUS
Зовнішні ІД	OMIM: 137070 GeneCards: FUS
Пов'язані генетичні захворювання
	Angiomatoid fibrous histiocytoma, amyotrophic lateral sclerosis type 6[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • зв'язування з іоном металу; • retinoid X receptor binding; • thyroid hormone receptor binding; • myosin V binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • nucleic acid binding; • ionotropic glutamate receptor binding; • estrogen receptor binding; • RNA binding; • chromatin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • polysome; • Перикаріон; • dendritic spine; • Нуклеоплазма; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • dendritic spine head; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• cellular response to calcium ion; • mRNA splicing, via spliceosome; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • Сплайсинг; • regulation of RNA splicing; • protein homooligomerization; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription; • positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2521
	н/д
	ENSG00000089280
	н/д
	P35637
	н/д
	NM_001010850; NM_001170634; NM_001170937; NM_004960
	н/д
	NP_001164105; NP_001164408; NP_004951
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

FUS (англ. FUS RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 53 426[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASNDYTQQA	TQSYGAYPTQ	PGQGYSQQSS	QPYGQQSYSG	YSQSTDTSGY
GQSSYSSYGQ	SQNTGYGTQS	TPQGYGSTGG	YGSSQSSQSS	YGQQSSYPGY
GQQPAPSSTS	GSYGSSSQSS	SYGQPQSGSY	SQQPSYGGQQ	QSYGQQQSYN
PPQGYGQQNQ	YNSSSGGGGG	GGGGGNYGQD	QSSMSSGGGS	GGGYGNQDQS
GGGGSGGYGQ	QDRGGRGRGG	SGGGGGGGGG	GYNRSSGGYE	PRGRGGGRGG
RGGMGGSDRG	GFNKFGGPRD	QGSRHDSEQD	NSDNNTIFVQ	GLGENVTIES
VADYFKQIGI	IKTNKKTGQP	MINLYTDRET	GKLKGEATVS	FDDPPSAKAA
IDWFDGKEFS	GNPIKVSFAT	RRADFNRGGG	NGRGGRGRGG	PMGRGGYGGG
GSGGGGRGGF	PSGGGGGGGQ	QRAGDWKCPN	PTCENMNFSW	RNECNQCKAP
KPDGPGGGPG	GSHMGGNYGD	DRRGGRGGYD	RGGYRGRGGD	RGGFRGGRGG
GDRGGFGPGK	MDSRGEHRQD	RRERPY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Crozat A., Aman P., Mandahl N., Ron D. (1993). Fusion of CHOP to a novel RNA-binding protein in human myxoid liposarcoma.. Nature 363: 640 — 644. PubMed DOI:10.1038/363640a0
Rabbitts T.H., Forster A., Larson R., Nathan P. (1993). Fusion of the dominant negative transcription regulator CHOP with a novel gene FUS by translocation t(12;16) in malignant liposarcoma.. Nat. Genet. 4: 175 — 180. PubMed DOI:10.1038/ng0693-175
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Waters B.L., Panagopoulos I., Allen E.F. (2000). Genetic characterization of angiomatoid fibrous histiocytoma identifies fusion of the FUS and ATF-1 genes induced by a chromosomal translocation involving bands 12q13 and 16p11.. Cancer Genet. Cytogenet. 121: 109 — 116. PubMed DOI:10.1016/S0165-4608(00)00237-5
Bertrand P., Akhmedov A.T., Delacote F., Durrbach A., Lopez B.S. (1999). Human POMp75 is identified as the pro-oncoprotein TLF/FUS: both POMp75 and POMp100 DNA homologous pairing activities are associated to cell proliferation.. Oncogene 18: 4515 — 4521. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203048
Zhang D., Paley A.J., Childs G. (1998). The transcriptional repressor ZFM1 interacts with and modulates the ability of EWS to activate transcription.. J. Biol. Chem. 273: 18086 — 18091. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.29.18086

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з FUS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4010 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P35637 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з FUS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4010 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P35637 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.