FYB1

FYB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RI9, 2GTJ, 2GTO
Ідентифікатори
Символи	FYB1, ADAP, PRO0823, SLAP-130, SLAP130, FYB, FYN binding protein, THC3, FYN binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602731 MGI: 1346327 HomoloGene: 22664 GeneCards: FYB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • lipid binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • actin cytoskeleton; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти;
Біологічний процес	• protein phosphorylation; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • protein localization to plasma membrane; • T cell receptor signaling pathway; • Імунна відповідь; • Сигнальна трансдукція; • NLS-bearing protein import into nucleus; • життєдіяльність; • integrin-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2533
	23880
	ENSG00000082074
	ENSMUSG00000022148
	O15117
	O35601
	NM_001243093; NM_001465; NM_199335; NM_001349333; NM_018594
	NM_001278269; NM_011815
	NP_001230022; NP_001456; NP_955367; NP_001336262; NP_061064
	NP_001265198; NP_035945
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FYB1 (англ. FYN binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 387[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKYNTGGNP	TEDVSVNSRP	FRVTGPNSSS	GIQARKNLFN	NQGNASPPAG
PSNVPKFGSP	KPPVAVKPSS	EEKPDKEPKP	PFLKPTGAGQ	RFGTPASLTT
RDPEAKVGFL	KPVGPKPINL	PKEDSKPTFP	WPPGNKPSLH	SVNQDHDLKP
LGPKSGPTPP	TSENEQKQAF	PKLTGVKGKF	MSASQDLEPK	PLFPKPAFGQ
KPPLSTENSH	EDESPMKNVS	SSKGSPAPLG	VRSKSGPLKP	AREDSENKDH
AGEISSLPFP	GVVLKPAASR	GGPGLSKNGE	EKKEDRKIDA	AKNTFQSKIN
QEELASGTPP	ARFPKAPSKL	TVGGPWGQSQ	EKEKGDKNSA	TPKQKPLPPL
FTLGPPPPKP	NRPPNVDLTK	FHKTSSGNST	SKGQTSYSTT	SLPPPPPSHP
ASQPPLPASH	PSQPPVPSLP	PRNIKPPFDL	KSPVNEDNQD	GVTHSDGAGN
LDEEQDSEGE	TYEDIEASKE	REKKREKEEK	KRLELEKKEQ	KEKEKKEQEI
KKKFKLTGPI	QVIHLAKACC	DVKGGKNELS	FKQGEQIEII	RITDNPEGKW
LGRTARGSYG	YIKTTAVEID	YDSLKLKKDS	LGAPSRPIED	DQEVYDDVAE
QDDISSHSQS	GSGGIFPPPP	DDDIYDGIEE	EDADDGFPAP	PKQLDMGDEV
YDDVDTSDFP	VSSAEMSQGT	NVGKAKTEEK	DLKKLKKQEK	EEKDFRKKFK
YDGEIRVLYS	TKVTTSITSK	KWGTRDLQVK	PGESLEVIQT	TDDTKVLCRN
EEGKYGYVLR	SYLADNDGEI	YDDIADGCIY	DND

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Marie-Cardine A., Verhagen A.M., Eckerskorn C., Schraven B. (1998). SKAP-HOM, a novel adaptor protein homologous to the FYN-associated protein SKAP55.. FEBS Lett. 435: 55 — 60. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(98)01040-0
Duke-Cohan J.S., Kang H., Liu H., Rudd C.E. (2006). Regulation and function of SKAP-55 non-canonical motif binding to the SH3c domain of adhesion and degranulation-promoting adaptor protein.. J. Biol. Chem. 281: 13743 — 13750. PubMed DOI:10.1074/jbc.M508774200
Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening.. BMC Immunol. 10: 53 — 53. PubMed DOI:10.1186/1471-2172-10-53
Hamamy H., Makrythanasis P., Al-Allawi N., Muhsin A.A., Antonarakis S.E. (2014). Recessive thrombocytopenia likely due to a homozygous pathogenic variant in the FYB gene: case report.. BMC Med. Genet. 15: 135 — 135. PubMed DOI:10.1186/s12881-014-0135-0
Heuer K., Kofler M., Langdon G., Thiemke K., Freund C. (2004). Structure of a helically extended SH3 domain of the T cell adapter protein ADAP.. Structure 12: 603 — 610. PubMed DOI:10.1016/j.str.2004.02.021

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4036 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, O15117 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4036 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O15117 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.