GAP43

GAP43
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4E53
Ідентифікатори
Символи	GAP43, B-50, PP46, growth associated protein 43, GAP-43
Зовнішні ІД	OMIM: 162060 MGI: 95639 HomoloGene: 1545 GeneCards: GAP43
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lysophosphatidic acid binding; • phosphatidylinositol phosphate binding; • phosphatidylserine binding; • calmodulin binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell projection; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • growth cone membrane; • Синапс; • Аксон; • Міжклітинні контакти; • cell periphery; • filopodium membrane; • клітинна мембрана; • GABA-ergic synapse;
Біологічний процес	• regulation of filopodium assembly; • Диференціація клітин; • cell fate commitment; • tissue regeneration; • glial cell differentiation; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • response to wounding; • regulation of growth; • axon choice point recognition; • axon development; • axon guidance; • regulation of postsynaptic specialization assembly; • axon regeneration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2596
	14432
	ENSG00000172020
	ENSMUSG00000047261
	P17677
	P06837
	NM_002045; NM_001130064
	NM_008083
	NP_001123536; NP_002036
	NP_032109
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GAP43 (англ. Growth associated protein 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 238 амінокислот, а молекулярна маса — 24 803[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLCCMRRTKQ	VEKNDDDQKI	EQDGIKPEDK	AHKAATKIQA	SFRGHITRKK
LKGEKKDDVQ	AAEAEANKKD	EAPVADGVEK	KGEGTTTAEA	APATGSKPDE
PGKAGETPSE	EKKGEGDAAT	EQAAPQAPAS	SEEKAGSAET	ESATKASTDN
SPSSKAEDAP	AKEEPKQADV	PAAVTAAAAT	TPAAEDAAAK	ATAQPPTETG
ESSQAEENIE	AVDETKPKES	ARQDEGKEEE	PEADQEHA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція росту, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Ng S.-C., de la Monte S.M., Conboy G.L., Karns L.R., Fishman M.C. (1988). Cloning of human GAP-43: growth association and ischemic resurgence.. Neuron 1: 133 — 139. PubMed DOI:10.1016/0896-6273(88)90197-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Gauthier-Campbell C., Bredt D.S., Murphy T.H., El-Husseini A. (2004). Regulation of dendritic branching and filopodia formation in hippocampal neurons by specific acylated protein motifs.. Mol. Biol. Cell 15: 2205 — 2217. PubMed DOI:10.1091/mbc.E03-07-0493
Tomatis V.M., Trenchi A., Gomez G.A., Daniotti J.L. (2010). Acyl-protein thioesterase 2 catalyzes the deacylation of peripheral membrane-associated GAP-43.. PLoS ONE 5: E15045 — E15045. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0015045

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4140 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P17677 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4140 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P17677 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.