GCFC2

GCFC2
Ідентифікатори
Символи	GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-rich sequence DNA-binding factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 189901 MGI: 2141656 HomoloGene: 2411 GeneCards: GCFC2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Ядерце; • клітинне ядро; • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• mRNA processing; • spliceosomal complex assembly; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • Сплайсинг; • mRNA splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6936
	330361
	ENSG00000005436
	ENSMUSG00000035125
	P16383
	Q8BKT3
	NM_001201334; NM_001201335; NM_003203
	NM_177884
	NP_001188263; NP_001188264; NP_003194
	NP_808552
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GCFC2 (англ. GC-rich sequence DNA-binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 89 385[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHRPKRTFR	QRAADSSDSD	GAEESPAEPG	APRELPVPGS	AEEEPPSGGG
RAQVAGLPHR	VRGPRGRGRV	WASSRRATKA	APRADEGSES	RTLDVSTDEE
DKIHHSSESK	DDQGLSSDSS	SSLGEKELSS	TVKIPDAAFI	QAARRKRELA
RAQDDYISLD	VQHTSSISGM	KRESEDDPES	EPDDHEKRIP	FTLRPQTLRQ
RMAEESISRN	EETSEESQED	EKQDTWEQQQ	MRKAVKIIEE	RDIDLSCGNG
SSKVKKFDTS	ISFPPVNLEI	IKKQLNTRLT	LLQETHRSHL	REYEKYVQDV
KSSKSTIQNL	ESSSNQALNC	KFYKSMKIYV	ENLIDCLNEK	IINIQEIESS
MHALLLKQAM	TFMKRRQDEL	KHESTYLQQL	SRKDETSTSG	NFSVDEKTQW
ILEEIESRRT	KRRQARVLSG	NCNHQEGTSS	DDELPSAEMI	DFQKSQGDIL
QKQKKVFEEV	QDDFCNIQNI	LLKFQQWREK	FPDSYYEAFI	SLCIPKLLNP
LIRVQLIDWN	PLKLESTGLK	EMPWFKSVEE	FMDSSVEDSK	KESSSDKKVL
SAIINKTIIP	RLTDFVEFLW	DPLSTSQTTS	LITHCRVILE	EHSTCENEVS
KSRQDLLKSI	VSRMKKAVED	DVFIPLYPKS	AVENKTSPHS	KFQERQFWSG
LKLFRNILLW	NGLLTDDTLQ	ELGLGKLLNR	YLIIALLNAT	PGPDVVKKCN
QVAACLPEKW	FENSAMRTSI	PQLENFIQFL	LQSAHKLSRS	EFRDEVEEII
LILVKIKALN	QAESFIGEHH	LDHLKSLIKE	D

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kageyama R., Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription.. Cell 59: 815 — 825. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(89)90605-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway.. Genes Cells 19: 78 — 87. PubMed DOI:10.1111/gtc.12114

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1317 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P16383 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1317 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P16383 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.