GTF2IRD1

GTF2IRD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D99, 2DN5, 2DZQ, 2DZR
Ідентифікатори
Символи	GTF2IRD1, BEN, CREAM1, GTF3, MUSTRD1, RBAP2, WBS, WBSCR11, WBSCR12, hMusTRD1alpha1, GTF2I repeat domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604318 MGI: 1861942 HomoloGene: 4158 GeneCards: GTF2IRD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • DNA binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • transition between slow and fast fiber; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9569
	57080
	ENSG00000006704
	ENSMUSG00000023079
	Q9UHL9
	Q9JI57
	NM_001199207; NM_005685; NM_016328
NM_001081462; NM_001081463; NM_001081464; NM_001081465; NM_001081466;
	NM_001081467; NM_001081468; NM_001081469; NM_001081470; NM_001244936; NM_020331; NM_001347488
	NP_001186136; NP_005676; NP_057412
NP_001074931; NP_001074932; NP_001074933; NP_001074934; NP_001074935;
	NP_001074936; NP_001074937; NP_001074938; NP_001074939; NP_001231865; NP_001334417; NP_065064
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GTF2IRD1 (англ. GTF2I repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 959 амінокислот, а молекулярна маса — 106 057[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALLGKRCDV	PTNGCGPDRW	NSAFTRKDEI	ITSLVSALDS	MCSALSKLNA
EVACVAVHDE	SAFVVGTEKG	RMFLNARKEL	QSDFLRFCRG	PPWKDPEAEH
PKKVQRGEGG	GRSLPRSSLE	HGSDVYLLRK	MVEEVFDVLY	SEALGRASVV
PLPYERLLRE	PGLLAVQGLP	EGLAFRRPAE	YDPKALMAIL	EHSHRIRFKL
KRPLEDGGRD	SKALVELNGV	SLIPKGSRDC	GLHGQAPKVP	PQDLPPTATS
SSMASFLYST	ALPNHAIREL	KQEAPSCPLA	PSDLGLSRPM	PEPKATGAQD
FSDCCGQKPT	GPGGPLIQNV	HASKRILFSI	VHDKSEKWDA	FIKETEDINT
LRECVQILFN	SRYAEALGLD	HMVPVPYRKI	ACDPEAVEIV	GIPDKIPFKR
PCTYGVPKLK	RILEERHSIH	FIIKRMFDER	IFTGNKFTKD	TTKLEPASPP
EDTSAEVSRA	TVLDLAGNAR	SDKGSMSEDC	GPGTSGELGG	LRPIKIEPED
LDIIQVTVPD	PSPTSEEMTD	SMPGHLPSED	SGYGMEMLTD	KGLSEDARPE
ERPVEDSHGD	VIRPLRKQVE	LLFNTRYAKA	IGISEPVKVP	YSKFLMHPEE
LFVVGLPEGI	SLRRPNCFGI	AKLRKILEAS	NSIQFVIKRP	ELLTEGVKEP
IMDSQGTASS	LGFSPPALPP	ERDSGDPLVD	ESLKRQGFQE	NYDARLSRID
IANTLREQVQ	DLFNKKYGEA	LGIKYPVQVP	YKRIKSNPGS	VIIEGLPPGI
PFRKPCTFGS	QNLERILAVA	DKIKFTVTRP	FQGLIPKPDE	DDANRLGEKV
ILREQVKELF	NEKYGEALGL	NRPVLVPYKL	IRDSPDAVEV	TGLPDDIPFR
NPNTYDIHRL	EKILKAREHV	RMVIINQLQP	FAEICNDAKV	PAKDSSIPKR
KRKRVSEGNS	VSSSSSSSSS	SSSNPDSVAS	ANQISLVQWP	MYMVDYAGLN
VQLPGPLNY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Osborne L.R., Campbell T., Daradich A., Scherer S.W., Tsui L.-C. (1999). Identification of a putative transcription factor gene (WBSCR11) that is commonly deleted in Williams-Beuren syndrome.. Genomics 57: 279 — 284. PubMed DOI:10.1006/geno.1999.5784
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tussie-Luna M.I., Bayarsaihan D., Ruddle F.H., Roy A.L. (2001). Repression of TFII-I-dependent transcription by nuclear exclusion.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 7789 — 7794. PubMed DOI:10.1073/pnas.141222298
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437. PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Franke Y., Peoples R.J., Francke U. (1999). Identification of GTF2IRD1, a putative transcription factor within the Williams-Beuren syndrome deletion at 7q11.23.. Cytogenet. Cell Genet. 86: 296 — 304. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4661 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, Q9UHL9 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4661 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UHL9 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.