H2AFZ

H2AFZ
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F66, 3WA9, 4CAY, 4NFT, 5FUG, 5CHL
Ідентифікатори
Символи	H2AZ1, H2A.Z-1, H2A.z, H2A/z, H2AZ, H2A histone family member Z, H2A.Z variant histone 1, H2AFZ
Зовнішні ІД	OMIM: 142763 MGI: 1888388 HomoloGene: 80218 GeneCards: H2AZ1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleosomal DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • chromatin DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• Нуклеосома; • Екзосома; • Тільце Барра; • клітинне ядро; • хромосома;
Біологічний процес	• cellular response to estradiol stimulus; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3015
	51788
	ENSG00000164032
	ENSMUSG00000037894
	P0C0S5
	P0C0S6
	NM_002106
	NM_016750; NM_001316995
	NP_002097
	NP_001303924; NP_058030
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

H2AFZ (англ. H2A histone family member Z) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 553[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGGKAGKDS	GKAKTKAVSR	SQRAGLQFPV	GRIHRHLKSR	TTSHGRVGAT
AAVYSAAILE	YLTAEVLELA	GNASKDLKVK	RITPRHLQLA	IRGDEELDSL
IKATIAGGGV	IPHIHKSLIG	KKGQQKTV

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Hatch C.L., Bonner W.M. (1988). Sequence of cDNAs for mammalian H2A.Z, an evolutionarily diverged but highly conserved basal histone H2A isoprotein species.. Nucleic Acids Res. 16: 1113 — 1124. PubMed DOI:10.1093/nar/16.3.1113
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Jason L.J.M., Moore S.C., Lewis J.D., Lindsey G., Ausio J. (2002). Histone ubiquitination: a tagging tail unfolds?. Bioessays 24: 166 — 174. PubMed DOI:10.1002/bies.10038
Boyne M.T. II, Pesavento J.J., Mizzen C.A., Kelleher N.L. (2006). Precise characterization of human histones in the H2A gene family by top down mass spectrometry.. J. Proteome Res. 5: 248 — 253. PubMed DOI:10.1021/pr050269n
Bonenfant D., Coulot M., Towbin H., Schindler P., van Oostrum J. (2006). Characterization of histones H2A and H2B variants and their post-translational modifications by mass spectrometry.. Mol. Cell. Proteomics 5: 541 — 552. PubMed DOI:10.1074/mcp.M500288-MCP200
Suto R.K., Clarkson M.J., Tremethick D.J., Luger K. (2000). Crystal structure of a nucleosome core particle containing the variant histone H2A.Z.. Nat. Struct. Biol. 7: 1121 — 1124. PubMed DOI:10.1038/81971

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4741 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P0C0S5 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4741 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P0C0S5 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.