HIST1H4J

HIST1H4J
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4H9O, 3WKJ, 3AYW, 3WA9, 5B0Z, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3AV2, 3WTP, 3AV1, 3AZK, 3X1V, 5AV8, 1F66, 4QUU, 3CFS, 4YYK, 4QUT, 3NQJ, 3A6N, 3W99, 5AVC, 2RS9, 3F9Z, 3QZT, 3QBY, 3W97, 4M38, 4YM6, 3CFV, 4HGA, 1EQZ, 2RJE, 3QZV, 1HQ3, 4H9P, 3AZL, 3AFA, 1TZY, 3UVY, 5CPK, 3JPX, 4U9W, 4N3W, 4YYJ, 4YYD, 4H9N, 4H9R, 3AZI, 4LD9, 3UVX, 3AZH, 5BNX, 4N4F, 1U35, 4YYG, 3O36, 2ARO, 5AV9, 4H9S, 3AZF, 3W98, 4GQB, 4H9Q, 5BNV, 3WAA, 3AZG, 3AZE, 2RNY, 1ZKK, 2QQS, 2LVM, 3X1T, 3AN2, 2KWO, 3QZS, 3F9W, 5FFW, 5CPJ, 3F9X, 3IJ1, 4YM5, 3AZJ, 4YY6, 3AZN, 2IG0, 4YYH, 4YYI, 5CPI, 3W96, 3R45, 2KWN, 3F9Y, 5AV6, 3AZM, 5BO0, 3X1S, 4QYD, 4KGC, 3UVW, 4YYN, 3X1U, 3UW9, 2F8N, 3NQU, 5B0Y, 4YYM, 5C3I, 4Z5T, 5B24, 5FA5, 4Z2M, 5E5A, 5FWE, 5B2I, 5B40, 5B2J, 5JA4, 5AY8, 4ZUX
Ідентифікатори
Символи	H4C11, H4/e, H4F2iv, H4FE, dJ160A22.2, histone cluster 1, H4j, histone cluster 1 H4 family member j, H4 clustered histone 11, HIST1H4J, H4C5, H4C4, H4C9, H4C12, H4-16, H4C3, H4C13, H4C1, H4C14, H4C15, H4C8, H4C6, H4C2
Зовнішні ІД	OMIM: 602826 MGI: 2448425 HomoloGene: 134492 GeneCards: H4C11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • DNA binding; • histone binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • хромосома; • Нуклеоплазма; • extracellular region; • nuclear chromosome; • Нуклеосома; • Екзосома; • клітинне ядро; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• telomere organization; • cellular protein metabolic process; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • protein heterotetramerization; • negative regulation of megakaryocyte differentiation; • CENP-A containing chromatin assembly; • DNA replication-dependent chromatin assembly; • rDNA heterochromatin assembly; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • DNA-templated transcription, initiation; • DNA replication-independent chromatin assembly; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • beta-catenin-TCF complex assembly; • telomere capping; • nucleosome assembly; • regulation of gene silencing by miRNA; • regulation of megakaryocyte differentiation; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8363
	319157
	ENSG00000197238
	ENSMUSG00000069274
	P62805
	P62806
	NM_021968
	NM_175655
NP_003537; NP_003486; NP_003535; NP_003539; NP_003531;
	NP_003536
	NP_291074
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIST1H4J (англ. Histone cluster 1 H4 family member k) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 103 амінокислот, а молекулярна маса — 11 367[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGRGKGGKG	LGKGGAKRHR	KVLRDNIQGI	TKPAIRRLAR	RGGVKRISGL
IYEETRGVLK	VFLENVIRDA	VTYTEHAKRK	TVTAMDVVYA	LKRQGRTLYG
FGG

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Sierra F., Stein G., Stein J. (1983). Structure and in vitro transcription of a human H4 histone gene.. Nucleic Acids Res. 11: 7069 — 7086. PubMed DOI:10.1093/nar/11.20.7069
Pauli U., Chrysogelos S., Stein G., Stein J., Nick H. (1987). Protein-DNA interactions in vivo upstream of a cell cycle-regulated human H4 histone gene.. Science 236: 1308 — 1311. PubMed DOI:10.1126/science.3035717
Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes.. Genomics 10: 940 — 948. PubMed DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Drabent B., Kardalinou E., Bode C., Doenecke D. (1995). Association of histone H4 genes with the mammalian testis-specific H1t histone gene.. DNA Cell Biol. 14: 591 — 597. PubMed DOI:10.1089/dna.1995.14.591
Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes.. Gene 184: 141 — 148. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
Albig W., Doenecke D. (1997). The human histone gene cluster at the D6S105 locus.. Hum. Genet. 101: 284 — 294. PubMed DOI:10.1007/s004390050630

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4781 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P62805 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4781 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P62805 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.