HNRNPK

HNRNPK
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1J5K, 1KHM, 1ZZI, 1ZZJ, 1ZZK
Ідентифікатори
Символи	HNRNPK, CSBP, HNRPK, TUNP, AUKS, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
Зовнішні ІД	OMIM: 600712 MGI: 99894 HomoloGene: 81909 GeneCards: HNRNPK
Пов'язані генетичні захворювання
	neurodevelopmental disorder-craniofacial dysmorphism-cardiac defect-hip dysplasia syndrome due to a point mutation, neurodevelopmental disorder-craniofacial dysmorphism-cardiac defect-hip dysplasia syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • DNA binding; • single-stranded DNA binding; • RNA binding; • cadherin binding; • protein domain specific binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • focal adhesion; • клітинне ядро; • catalytic step 2 spliceosome; • cell projection; • Екзосома; • podosome; • spliceosomal complex; • Міжклітинні контакти; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Нуклеоплазма; • cytoplasmic stress granule;
Біологічний процес	• positive regulation of receptor-mediated endocytosis; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0022415 viral process; • RNA processing; • mRNA processing; • regulation of low-density lipoprotein particle clearance; • mRNA splicing, via spliceosome; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of apoptotic process; • Сплайсинг; • transcription by RNA polymerase II; • RNA metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3190
	15387
	ENSG00000165119
	ENSMUSG00000021546
	P61978
	P61979
NM_002140; NM_031262; NM_031263; NM_001318186; NM_001318187;
	NM_001318188
NM_001301340; NM_001301341; NM_001301343; NM_001301344; NM_001301345;
	NM_025279
NP_001305115; NP_001305116; NP_001305117; NP_002131; NP_112552;
	NP_112553
NP_001288269; NP_001288270; NP_001288272; NP_001288273; NP_001288274;
	NP_079555; NP_001347419; NP_001347420; NP_001347422; NP_001347423; NP_001347424
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HNRNPK (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 976[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METEQPEETF	PNTETNGEFG	KRPAEDMEEE	QAFKRSRNTD	EMVELRILLQ
SKNAGAVIGK	GGKNIKALRT	DYNASVSVPD	SSGPERILSI	SADIETIGEI
LKKIIPTLEE	GLQLPSPTAT	SQLPLESDAV	ECLNYQHYKG	SDFDCELRLL
IHQSLAGGII	GVKGAKIKEL	RENTQTTIKL	FQECCPHSTD	RVVLIGGKPD
RVVECIKIIL	DLISESPIKG	RAQPYDPNFY	DETYDYGGFT	MMFDDRRGRP
VGFPMRGRGG	FDRMPPGRGG	RPMPPSRRDY	DDMSPRRGPP	PPPPGRGGRG
GSRARNLPLP	PPPPPRGGDL	MAYDRRGRPG	DRYDGMVGFS	ADETWDSAID
TWSPSEWQMA	YEPQGGSGYD	YSYAGGRGSY	GDLGGPIITT	QVTIPKDLAG
SIIGKGGQRI	KQIRHESGAS	IKIDEPLEGS	EDRIITITGT	QDQIQNAQYL
LQNSVKQYSG	KFF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Matunis M.J., Michael W.M., Dreyfuss G. (1992). Characterization and primary structure of the poly(C)-binding heterogeneous nuclear ribonucleoprotein complex K protein.. Mol. Cell. Biol. 12: 164 — 171. PubMed DOI:10.1128/MCB.12.1.164
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chen H.C., Lin W.C., Tsay Y.G., Lee S.C., Chang C.J. (2002). An RNA helicase, DDX1, interacting with poly(A) RNA and heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K.. J. Biol. Chem. 277: 40403 — 40409. PubMed DOI:10.1074/jbc.M206981200
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis.. RNA 8: 426 — 439. PubMed DOI:10.1017/S1355838202021088
Moumen A., Masterson P., O'Connor M.J., Jackson S.P. (2005). hnRNP K: an HDM2 target and transcriptional coactivator of p53 in response to DNA damage.. Cell 123: 1065 — 1078. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2005.09.032
Kwiek N.C., Thacker D.F., Datto M.B., Megosh H.B., Haystead T.A.J. (2006). PITK, a PP1 targeting subunit that modulates the phosphorylation of the transcriptional regulator hnRNP K.. Cell. Signal. 18: 1769 — 1778. PubMed DOI:10.1016/j.cellsig.2006.01.019

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HNRNPK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5044 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P61978 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HNRNPK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5044 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-5] UniProt, P61978 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.