HSPG2

HSPG2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3SH4, 3SH5
Ідентифікатори
Символи	HSPG2, HSPG, PLC, PRCAN, SJA, SJS, SJS1, heparan sulfate proteoglycan 2
Зовнішні ІД	OMIM: 142461 MGI: 96257 HomoloGene: 68473 GeneCards: HSPG2
Пов'язані генетичні захворювання
	Schwartz-Jampel syndrome 1, Silverman-Handmaker type dyssegmental dysplasia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • calcium ion binding; • protein C-terminus binding; • amyloid-beta binding; • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance; • low-density lipoprotein particle receptor binding;
Клітинна компонента	• Базальна мембрана; • Golgi lumen; • Екзосома; • lysosomal lumen; • extracellular region; • клітинна мембрана; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • focal adhesion; • extracellular space; • collagen-containing extracellular matrix; • plasma membrane protein complex;
Біологічний процес	• glycosaminoglycan metabolic process; • extracellular matrix disassembly; • cellular protein metabolic process; • retinoid metabolic process; • glycosaminoglycan biosynthetic process; • glycosaminoglycan catabolic process; • Ангіогенез; • extracellular matrix organization; • lipid metabolism; • Рецептор-опосередкований ендоцитоз; • inflammatory response; • brain development; • negative regulation of angiogenesis; • Диференціація клітин; • animal organ morphogenesis; • Гістогенез; • cell migration; • substrate adhesion-dependent cell spreading;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3339
	15530
	ENSG00000142798
	ENSMUSG00000028763
	P98160
	Q05793
	NM_001291860; NM_005529
	NM_008305
	NP_001278789; NP_005520
	NP_032331
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HSPG2 (англ. Heparan sulfate proteoglycan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 391 амінокислот, а молекулярна маса — 468 830[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGWRAAGALL	LALLLHGRLL	AVTHGLRAYD	GLSLPEDIET	VTASQMRWTH
SYLSDDEDML	ADSISGDDLG	SGDLGSGDFQ	MVYFRALVNF	TRSIEYSPQL
EDAGSREFRE	VSEAVVDTLE	SEYLKIPGDQ	VVSVVFIKEL	DGWVFVELDV
GSEGNADGAQ	IQEMLLRVIS	SGSVASYVTS	PQGFQFRRLG	TVPQFPRACT
EAEFACHSYN	ECVALEYRCD	RRPDCRDMSD	ELNCEEPVLG	ISPTFSLLVE
TTSLPPRPET	TIMRQPPVTH	APQPLLPGSV	RPLPCGPQEA	ACRNGHCIPR
DYLCDGQEDC	EDGSDELDCG	PPPPCEPNEF	PCGNGHCALK	LWRCDGDFDC
EDRTDEANCP	TKRPEEVCGP	TQFRCVSTNM	CIPASFHCDE	ESDCPDRSDE
FGCMPPQVVT	PPRESIQASR	GQTVTFTCVA	IGVPTPIINW	RLNWGHIPSH
PRVTVTSEGG	RGTLIIRDVK	ESDQGAYTCE	AMNARGMVFG	IPDGVLELVP
QRGPCPDGHF	YLEHSAACLP	CFCFGITSVC	QSTRRFRDQI	RLRFDQPDDF
KGVNVTMPAQ	PGTPPLSSTQ	LQIDPSLHEF	QLVDLSRRFL	VHDSFWALPE
QFLGNKVDSY	GGSLRYNVRY	ELARGMLEPV	QRPDVVLMGA	GYRLLSRGHT
PTQPGALNQR	QVQFSEEHWV	HESGRPVQRA	ELLQVLQSLE	AVLIQTVYNT
KMASVGLSDI	AMDTTVTHAT	SHGRAHSVEE	CRCPIGYSGL	SCESCDAHFT
RVPGGPYLGT	CSGCNCNGHA	SSCDPVYGHC	LNCQHNTEGP	QCNKCKAGFF
GDAMKATATS	CRPCPCPYID	ASRRFSDTCF	LDTDGQATCD	ACAPGYTGRR
CESCAPGYEG	NPIQPGGKCR	PVNQEIVRCD	ERGSMGTSGE	ACRCKNNVVG
RLCNECADGS	FHLSTRNPDG	CLKCFCMGVS	RHCTSSSWSR	AQLHGASEEP
GHFSLTNAAS	THTTNEGIFS	PTPGELGFSS	FHRLLSGPYF	WSLPSRFLGD
KVTSYGGELR	FTVTQRSQPG	STPLHGQPLV	VLQGNNIILE	HHVAQEPSPG
QPSTFIVPFR	EQAWQRPDGQ	PATREHLLMA	LAGIDTLLIR	ASYAQQPAES
RVSGISMDVA	VPEETGQDPA	LEVEQCSCPP	GYRGPSCQDC	DTGYTRTPSG
LYLGTCERCS	CHGHSEACEP	ETGACQGCQH	HTEGPRCEQC	QPGYYGDAQR
GTPQDCQLCP	CYGDPAAGQA	AHTCFLDTDG	HPTCDACSPG	HSGRHCERCA
PGYYGNPSQG	QPCQRDSQVP	GPIGCNCDPQ	GSVSSQCDAA	GQCQCKAQVE
GLTCSHCRPH	HFHLSASNPD	GCLPCFCMGI	TQQCASSAYT	RHLISTHFAP
GDFQGFALVN	PQRNSRLTGE	FTVEPVPEGA	QLSFGNFAQL	GHESFYWQLP
ETYQGDKVAA	YGGKLRYTLS	YTAGPQGSPL	SDPDVQITGN	NIMLVASQPA
LQGPERRSYE	IMFREEFWRR	PDGQPATREH	LLMALADLDE	LLIRATFSSV
PLAASISAVS	LEVAQPGPSN	RPRALEVEEC	RCPPGYIGLS	CQDCAPGYTR
TGSGLYLGHC	ELCECNGHSD	LCHPETGACS	QCQHNAAGEF	CELCAPGYYG
DATAGTPEDC	QPCACPLTNP	ENMFSRTCES	LGAGGYRCTA	CEPGYTGQYC
EQCGPGYVGN	PSVQGGQCLP	ETNQAPLVVE	VHPARSIVPQ	GGSHSLRCQV
SGSPPHYFYW	SREDGRPVPS	GTQQRHQGSE	LHFPSVQPSD	AGVYICTCRN
LHQSNTSRAE	LLVTEAPSKP	ITVTVEEQRS	QSVRPGADVT	FICTAKSKSP
AYTLVWTRLH	NGKLPTRAMD	FNGILTIRNV	QLSDAGTYVC	TGSNMFAMDQ
GTATLHVQAS	GTLSAPVVSI	HPPQLTVQPG	QLAEFRCSAT	GSPTPTLEWT
GGPGGQLPAK	AQIHGGILRL	PAVEPTDQAQ	YLCRAHSSAG	QQVARAVLHV
HGGGGPRVQV	SPERTQVHAG	RTVRLYCRAA	GVPSATITWR	KEGGSLPPQA
RSERTDIATL	LIPAITTADA	GFYLCVATSP	AGTAQARIQV	VVLSASDASP
PPVKIESSSP	SVTEGQTLDL	NCVVAGSAHA	QVTWYRRGGS	LPPHTQVHGS
RLRLPQVSPA	DSGEYVCRVE	NGSGPKEASI	TVSVLHGTHS	GPSYTPVPGS
TRPIRIEPSS	SHVAEGQTLD	LNCVVPGQAH	AQVTWHKRGG	SLPARHQTHG
SLLRLHQVTP	ADSGEYVCHV	VGTSGPLEAS	VLVTIEASVI	PGPIPPVRIE
SSSSTVAEGQ	TLDLSCVVAG	QAHAQVTWYK	RGGSLPARHQ	VRGSRLYIFQ
ASPADAGQYV	CRASNGMEAS	ITVTVTGTQG	ANLAYPAGST	QPIRIEPSSS
QVAEGQTLDL	NCVVPGQSHA	QVTWHKRGGS	LPVRHQTHGS	LLRLYQASPA
DSGEYVCRVL	GSSVPLEASV	LVTIEPAGSV	PALGVTPTVR	IESSSSQVAE
GQTLDLNCLV	AGQAHAQVTW	HKRGGSLPAR	HQVHGSRLRL	LQVTPADSGE
YVCRVVGSSG	TQEASVLVTI	QQRLSGSHSQ	GVAYPVRIES	SSASLANGHT
LDLNCLVASQ	APHTITWYKR	GGSLPSRHQI	VGSRLRIPQV	TPADSGEYVC
HVSNGAGSRE	TSLIVTIQGS	GSSHVPSVSP	PIRIESSSPT	VVEGQTLDLN
CVVARQPQAI	ITWYKRGGSL	PSRHQTHGSH	LRLHQMSVAD	SGEYVCRANN
NIDALEASIV	ISVSPSAGSP	SAPGSSMPIR	IESSSSHVAE	GETLDLNCVV
PGQAHAQVTW	HKRGGSLPSH	HQTRGSRLRL	HHVSPADSGE	YVCRVMGSSG
PLEASVLVTI	EASGSSAVHV	PAPGGAPPIR	IEPSSSRVAE	GQTLDLKCVV
PGQAHAQVTW	HKRGGNLPAR	HQVHGPLLRL	NQVSPADSGE	YSCQVTGSSG
TLEASVLVTI	EPSSPGPIPA	PGLAQPIYIE	ASSSHVTEGQ	TLDLNCVVPG
QAHAQVTWYK	RGGSLPARHQ	THGSQLRLHL	VSPADSGEYV	CRAASGPGPE
QEASFTVTVP	PSEGSSYRLR	SPVISIDPPS	STVQQGQDAS	FKCLIHDGAA
PISLEWKTRN	QELEDNVHIS	PNGSIITIVG	TRPSNHGTYR	CVASNAYGVA
QSVVNLSVHG	PPTVSVLPEG	PVWVKVGKAV	TLECVSAGEP	RSSARWTRIS
STPAKLEQRT	YGLMDSHAVL	QISSAKPSDA	GTYVCLAQNA	LGTAQKQVEV
IVDTGAMAPG	APQVQAEEAE	LTVEAGHTAT	LRCSATGSPA	PTIHWSKLRS
PLPWQHRLEG	DTLIIPRVAQ	QDSGQYICNA	TSPAGHAEAT	IILHVESPPY
ATTVPEHASV	QAGETVQLQC	LAHGTPPLTF	QWSRVGSSLP	GRATARNELL
HFERAAPEDS	GRYRCRVTNK	VGSAEAFAQL	LVQGPPGSLP	ATSIPAGSTP
TVQVTPQLET	KSIGASVEFH	CAVPSDRGTQ	LRWFKEGGQL	PPGHSVQDGV
LRIQNLDQSC	QGTYICQAHG	PWGKAQASAQ	LVIQALPSVL	INIRTSVQTV
VVGHAVEFEC	LALGDPKPQV	TWSKVGGHLR	PGIVQSGGVV	RIAHVELADA
GQYRCTATNA	AGTTQSHVLL	LVQALPQISM	PQEVRVPAGS	AAVFPCIASG
YPTPDISWSK	LDGSLPPDSR	LENNMLMLPS	VRPQDAGTYV	CTATNRQGKV
KAFAHLQVPE	RVVPYFTQTP	YSFLPLPTIK	DAYRKFEIKI	TFRPDSADGM
LLYNGQKRVP	GSPTNLANRQ	PDFISFGLVG	GRPEFRFDAG	SGMATIRHPT
PLALGHFHTV	TLLRSLTQGS	LIVGDLAPVN	GTSQGKFQGL	DLNEELYLGG
YPDYGAIPKA	GLSSGFIGCV	RELRIQGEEI	VFHDLNLTAH	GISHCPTCRD
RPCQNGGQCH	DSESSSYVCV	CPAGFTGSRC	EHSQALHCHP	EACGPDATCV
NRPDGRGYTC	RCHLGRSGLR	CEEGVTVTTP	SLSGAGSYLA	LPALTNTHHE
LRLDVEFKPL	APDGVLLFSG	GKSGPVEDFV	SLAMVGGHLE	FRYELGSGLA
VLRSAEPLAL	GRWHRVSAER	LNKDGSLRVN	GGRPVLRSSP	GKSQGLNLHT
LLYLGGVEPS	VPLSPATNMS	AHFRGCVGEV	SVNGKRLDLT	YSFLGSQGIG
QCYDSSPCER	QPCQHGATCM	PAGEYEFQCL	CRDGFKGDLC	EHEENPCQLR
EPCLHGGTCQ	GTRCLCLPGF	SGPRCQQGSG	HGIAESDWHL	EGSGGNDAPG
QYGAYFHDDG	FLAFPGHVFS	RSLPEVPETI	ELEVRTSTAS	GLLLWQGVEV
GEAGQGKDFI	SLGLQDGHLV	FRYQLGSGEA	RLVSEDPIND	GEWHRVTALR
EGRRGSIQVD	GEELVSGRSP	GPNVAVNAKG	SVYIGGAPDV	ATLTGGRFSS
GITGCVKNLV	LHSARPGAPP	PQPLDLQHRA	QAGANTRPCP	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як ангіогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Kallunki P., Tryggvason K. (1992). Human basement membrane heparan sulfate proteoglycan core protein: a 467-kD protein containing multiple domains resembling elements of the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor.. J. Cell Biol. 116: 559 — 571. PubMed DOI:10.1083/jcb.116.2.559
Cohen I.R., Graessel S., Murdoch A.D., Iozzo R.V. (1993). Structural characterization of the complete human perlecan gene and its promoter.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10404 — 10408. PubMed DOI:10.1073/pnas.90.21.10404
Mongiat M., Sweeney S.M., San Antonio J.D., Fu J., Iozzo R.V. (2003). Endorepellin, a novel inhibitor of angiogenesis derived from the C terminus of perlecan.. J. Biol. Chem. 278: 4238 — 4249. PubMed DOI:10.1074/jbc.M210445200
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD.. Mol. Cell. Proteomics: —. PubMed DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Murdoch A.D., Dodge G.R., Cohen I., Tuan R.S., Iozzo R.V. (1992). Primary structure of the human heparan sulfate proteoglycan from basement membrane (HSPG2/perlecan). A chimeric molecule with multiple domains homologous to the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor.. J. Biol. Chem. 267: 8544 — 8557. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HSPG2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5273 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P98160 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HSPG2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5273 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-5] UniProt, P98160 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.