ITGA1

ITGA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 4A0Q, 2M32
Ідентифікатори
Символи	ITGA1, CD49a, VLA1, integrin subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 192968 MGI: 96599 HomoloGene: 57137 GeneCards: ITGA1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• collagen binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • collagen binding involved in cell-matrix adhesion; • protein phosphatase binding; • signaling receptor binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Перикаріон; • integrin alpha1-beta1 complex; • мембрана; • focal adhesion; • basal part of cell; • клітинна мембрана; • cell surface; • integrin complex; • Акросома; • membrane raft; • neuron projection; • Екзосома; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• neuron projection morphogenesis; • м'язове скорочення; • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • extracellular matrix organization; • vasodilation; • neutrophil chemotaxis; • positive regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • Адгезія клітин; • cell chemotaxis; • integrin-mediated signaling pathway; • cellular extravasation; • cell-matrix adhesion; • negative regulation of cell population proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3672
	109700
	ENSG00000213949
	ENSMUSG00000042284
	P56199
	Q3V3R4
	NM_181501
	NM_001033228
	NP_852478
	NP_001028400
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGA1 (англ. Integrin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 130 848[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPRPRARPG	VAVACCWLLT	VVLRCCVSFN	VDVKNSMTFS	GPVEDMFGYT
VQQYENEEGK	WVLIGSPLVG	QPKNRTGDVY	KCPVGRGESL	PCVKLDLPVN
TSIPNVTEVK	ENMTFGSTLV	TNPNGGFLAC	GPLYAYRCGH	LHYTTGICSD
VSPTFQVVNS	IAPVQECSTQ	LDIVIVLDGS	NSIYPWDSVT	AFLNDLLERM
DIGPKQTQVG	IVQYGENVTH	EFNLNKYSST	EEVLVAAKKI	VQRGGRQTMT
ALGIDTARKE	AFTEARGARR	GVKKVMVIVT	DGESHDNHRL	KKVIQDCEDE
NIQRFSIAIL	GSYNRGNLST	EKFVEEIKSI	ASEPTEKHFF	NVSDELALVT
IVKTLGERIF	ALEATADQSA	ASFEMEMSQT	GFSAHYSQDW	VMLGAVGAYD
WNGTVVMQKA	SQIIIPRNTT	FNVESTKKNE	PLASYLGYTV	NSATASSGDV
LYIAGQPRYN	HTGQVIIYRM	EDGNIKILQT	LSGEQIGSYF	GSILTTTDID
KDSNTDILLV	GAPMYMGTEK	EEQGKVYVYA	LNQTRFEYQM	SLEPIKQTCC
SSRQHNSCTT	ENKNEPCGAR	FGTAIAAVKD	LNLDGFNDIV	IGAPLEDDHG
GAVYIYHGSG	KTIRKEYAQR	IPSGGDGKTL	KFFGQSIHGE	MDLNGDGLTD
VTIGGLGGAA	LFWSRDVAVV	KVTMNFEPNK	VNIQKKNCHM	EGKETVCINA
TVCFDVKLKS	KEDTIYEADL	QYRVTLDSLR	QISRSFFSGT	QERKVQRNIT
VRKSECTKHS	FYMLDKHDFQ	DSVRITLDFN	LTDPENGPVL	DDSLPNSVHE
YIPFAKDCGN	KEKCISDLSL	HVATTEKDLL	IVRSQNDKFN	VSLTVKNTKD
SAYNTRTIVH	YSPNLVFSGI	EAIQKDSCES	NHNITCKVGY	PFLRRGEMVT
FKILFQFNTS	YLMENVTIYL	SATSDSEEPP	ETLSDNVVNI	SIPVKYEVGL
QFYSSASEYH	ISIAANETVP	EVINSTEDIG	NEINIFYLIR	KSGSFPMPEL
KLSISFPNMT	SNGYPVLYPT	GLSSSENANC	RPHIFEDPFS	INSGKKMTTS
TDHLKRGTIL	DCNTCKFATI	TCNLTSSDIS	QVNVSLILWK	PTFIKSYFSS
LNLTIRGELR	SENASLVLSS	SNQKRELAIQ	ISKDGLPGRV	PLWVILLSAF
AGLLLLMLLI	LALWKIGFFK	RPLKKKMEK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Briesewitz R., Epstein M.R., Marcantonio E.E. (1993). Expression of native and truncated forms of the human integrin alpha 1 subunit.. J. Biol. Chem. 268: 2989 — 2996. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6134 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P56199 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6134 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P56199 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.