ITGA4

ITGA4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z
Ідентифікатори
Символи	ITGA4, CD49D, IA4, integrin subunit alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 GeneCards: ITGA4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • protein antigen binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0003823 antigen binding; • fibronectin binding; • cell adhesion molecule binding; • coreceptor activity; • C-X3-C chemokine binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• Екзосома; • integral component of membrane; • мембрана; • focal adhesion; • cell surface; • integrin alpha4-beta7 complex; • integrin complex; • клітинна мембрана; • growth cone; • neuronal cell body; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• endodermal cell differentiation; • B cell differentiation; • positive regulation of T cell migration; • extracellular matrix organization; • heterotypic cell-cell adhesion; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • cellular response to cytokine stimulus; • cell-matrix adhesion involved in ameboidal cell migration; • cell-matrix adhesion; • leukocyte tethering or rolling; • Діапедез; • regulation of immune response; • integrin-mediated signaling pathway; • leukocyte migration; • positive regulation of leukocyte tethering or rolling; • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion; • positive regulation of leukocyte migration; • import into cell; • leukocyte cell-cell adhesion; • negative regulation of protein homodimerization activity; • clathrin-dependent extracellular exosome endocytosis; • адгезія клітин; • receptor clustering; • cell-cell adhesion mediated by integrin; • axonogenesis involved in innervation; • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation; • neuron projection extension; • positive regulation of endothelial cell apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3676
	16401
	ENSG00000115232
	ENSMUSG00000027009
	P13612
	Q00651
	NM_000885; NM_001316312
	NM_010576
	NP_000876; NP_001303241
	NP_034706
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGA4 (англ. Integrin subunit alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 114 900[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWEARREPG	PRRAAVRETV	MLLLCLGVPT	GRPYNVDTES	ALLYQGPHNT
LFGYSVVLHS	HGANRWLLVG	APTANWLANA	SVINPGAIYR	CRIGKNPGQT
CEQLQLGSPN	GEPCGKTCLE	ERDNQWLGVT	LSRQPGENGS	IVTCGHRWKN
IFYIKNENKL	PTGGCYGVPP	DLRTELSKRI	APCYQDYVKK	FGENFASCQA
GISSFYTKDL	IVMGAPGSSY	WTGSLFVYNI	TTNKYKAFLD	KQNQVKFGSY
LGYSVGAGHF	RSQHTTEVVG	GAPQHEQIGK	AYIFSIDEKE	LNILHEMKGK
KLGSYFGASV	CAVDLNADGF	SDLLVGAPMQ	STIREEGRVF	VYINSGSGAV
MNAMETNLVG	SDKYAARFGE	SIVNLGDIDN	DGFEDVAIGA	PQEDDLQGAI
YIYNGRADGI	SSTFSQRIEG	LQISKSLSMF	GQSISGQIDA	DNNGYVDVAV
GAFRSDSAVL	LRTRPVVIVD	ASLSHPESVN	RTKFDCVENG	WPSVCIDLTL
CFSYKGKEVP	GYIVLFYNMS	LDVNRKAESP	PRFYFSSNGT	SDVITGSIQV
SSREANCRTH	QAFMRKDVRD	ILTPIQIEAA	YHLGPHVISK	RSTEEFPPLQ
PILQQKKEKD	IMKKTINFAR	FCAHENCSAD	LQVSAKIGFL	KPHENKTYLA
VGSMKTLMLN	VSLFNAGDDA	YETTLHVKLP	VGLYFIKILE	LEEKQINCEV
TDNSGVVQLD	CSIGYIYVDH	LSRIDISFLL	DVSSLSRAEE	DLSITVHATC
ENEEEMDNLK	HSRVTVAIPL	KYEVKLTVHG	FVNPTSFVYG	SNDENEPETC
MVEKMNLTFH	VINTGNSMAP	NVSVEIMVPN	SFSPQTDKLF	NILDVQTTTG
ECHFENYQRV	CALEQQKSAM	QTLKGIVRFL	SKTDKRLLYC	IKADPHCLNF
LCNFGKMESG	KEASVHIQLE	GRPSILEMDE	TSALKFEIRA	TGFPEPNPRV
IELNKDENVA	HVLLEGLHHQ	RPKRYFTIVI	ISSSLLLGLI	VLLLISYVMW
KAGFFKRQYK	SILQEENRRD	SWSYINSKSN	DD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Rubio M., Nueda A., Vara A., Corbi-Lopez A.L. (1992). A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80/70 forms of the alpha subunit of VLA4.. Eur. J. Immunol. 22: 1099 — 1102. PubMed DOI:10.1002/eji.1830220434
Szabo M.C., McIntyre B.W. (1995). Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit.. Mol. Immunol. 32: 1453 — 1454. PubMed DOI:10.1016/0161-5890(96)00001-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Rosen G.D., Birkenmeier T.M., Dean D.C. (1991). Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4094 — 4098. PubMed DOI:10.1073/pnas.88.10.4094
Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239 — 3243. PubMed DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
Luissint A.C., Lutz P.G., Calderwood D.A., Couraud P.O., Bourdoulous S. (2008). JAM-L-mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation.. J. Cell Biol. 183: 1159 — 1173. PubMed DOI:10.1083/jcb.200805061

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6140 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P13612 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6140 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P13612 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.