ITGAL

ITGAL
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4IXD, 1CQP, 1DGQ, 1LFA, 1MJN, 1MQ8, 1MQ9, 1MQA, 1RD4, 1T0P, 1XDD, 1XDG, 1XUO, 1ZON, 1ZOO, 1ZOP, 2ICA, 2K8O, 2M3E, 2O7N, 3BN3, 3BQM, 3BQN, 3E2M, 3EOA, 3EOB, 3F74, 3F78, 3HI6, 3M6F, 3TCX, 5E6S, 5E6R, 5E6U
Ідентифікатори
Символи	ITGAL, CD11A, LFA-1, LFA1A, integrin subunit alpha L
Зовнішні ІД	OMIM: 153370 MGI: 96606 HomoloGene: 1666 GeneCards: ITGAL
Пов'язані генетичні захворювання
	неспецифічний виразковий коліт[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • ICAM-3 receptor activity; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integrin alphaL-beta2 complex; • мембрана; • cell surface; • integrin complex; • Екзосома; • клітинна мембрана; • specific granule membrane;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • movement of cell or subcellular component; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell; • extracellular matrix organization; • receptor clustering; • адгезія клітин; • regulation of immune response; • integrin-mediated signaling pathway; • cell-matrix adhesion; • inflammatory response; • leukocyte migration; • Сигнальна трансдукція; • Фагоцитоз; • neutrophil degranulation; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3683
	16408
	ENSG00000005844
	ENSMUSG00000030830
	P20701
	P24063
	NM_001114380; NM_002209
	NM_001253872; NM_001253873; NM_001253874; NM_008400
	NP_001107852; NP_002200
	NP_001240801; NP_001240802; NP_001240803; NP_032426
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGAL (англ. Integrin subunit alpha L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 170 амінокислот, а молекулярна маса — 128 770[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKDSCITVMA	MALLSGFFFF	APASSYNLDV	RGARSFSPPR	AGRHFGYRVL
QVGNGVIVGA	PGEGNSTGSL	YQCQSGTGHC	LPVTLRGSNY	TSKYLGMTLA
TDPTDGSILA	CDPGLSRTCD	QNTYLSGLCY	LFRQNLQGPM	LQGRPGFQEC
IKGNVDLVFL	FDGSMSLQPD	EFQKILDFMK	DVMKKLSNTS	YQFAAVQFST
SYKTEFDFSD	YVKRKDPDAL	LKHVKHMLLL	TNTFGAINYV	ATEVFREELG
ARPDATKVLI	IITDGEATDS	GNIDAAKDII	RYIIGIGKHF	QTKESQETLH
KFASKPASEF	VKILDTFEKL	KDLFTELQKK	IYVIEGTSKQ	DLTSFNMELS
SSGISADLSR	GHAVVGAVGA	KDWAGGFLDL	KADLQDDTFI	GNEPLTPEVR
AGYLGYTVTW	LPSRQKTSLL	ASGAPRYQHM	GRVLLFQEPQ	GGGHWSQVQT
IHGTQIGSYF	GGELCGVDVD	QDGETELLLI	GAPLFYGEQR	GGRVFIYQRR
QLGFEEVSEL	QGDPGYPLGR	FGEAITALTD	INGDGLVDVA	VGAPLEEQGA
VYIFNGRHGG	LSPQPSQRIE	GTQVLSGIQW	FGRSIHGVKD	LEGDGLADVA
VGAESQMIVL	SSRPVVDMVT	LMSFSPAEIP	VHEVECSYST	SNKMKEGVNI
TICFQIKSLI	PQFQGRLVAN	LTYTLQLDGH	RTRRRGLFPG	GRHELRRNIA
VTTSMSCTDF	SFHFPVCVQD	LISPINVSLN	FSLWEEEGTP	RDQRAQGKDI
PPILRPSLHS	ETWEIPFEKN	CGEDKKCEAN	LRVSFSPARS	RALRLTAFAS
LSVELSLSNL	EEDAYWVQLD	LHFPPGLSFR	KVEMLKPHSQ	IPVSCEELPE
ESRLLSRALS	CNVSSPIFKA	GHSVALQMMF	NTLVNSSWGD	SVELHANVTC
NNEDSDLLED	NSATTIIPIL	YPINILIQDQ	EDSTLYVSFT	PKGPKIHQVK
HMYQVRIQPS	IHDHNIPTLE	AVVGVPQPPS	EGPITHQWSV	QMEPPVPCHY
EDLERLPDAA	EPCLPGALFR	CPVVFRQEIL	VQVIGTLELV	GEIEASSMFS
LCSSLSISFN	SSKHFHLYGS	NASLAQVVMK	VDVVYEKQML	YLYVLSGIGG
LLLLLLIFIV	LYKVGFFKRN	LKEKMEAGRG	VPNGIPAEDS	EQLASGQEAG
DPGCLKPLHE	KDSESGGGKD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Larson R.S., Corbi A.L., Berman L., Springer T. (1989). Primary structure of the leukocyte function-associated molecule-1 alpha subunit: an integrin with an embedded domain defining a protein superfamily.. J. Cell Biol. 108: 703 — 712. PubMed DOI:10.1083/jcb.108.2.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Shelley C.S., Farokhzad O.C., Arnaout M.A. (1993). Identification of cell-specific and developmentally regulated nuclear factors that direct myeloid and lymphoid expression of the CD11a gene.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5364 — 5368. PubMed DOI:10.1073/pnas.90.11.5364
Cornwell R.D., Gollahon K.A., Hickstein D.D. (1993). Description of the leukocyte function-associated antigen 1 (LFA-1 or CD11a) promoter.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 4221 — 4225. PubMed DOI:10.1073/pnas.90.9.4221
Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes.. Nat. Immunol. 3: 151 — 158. PubMed DOI:10.1038/ni755
Barber D.F., Faure M., Long E.O. (2004). LFA-1 contributes an early signal for NK cell cytotoxicity.. J. Immunol. 173: 3653 — 3659. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.173.6.3653

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з ITGAL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6148 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P20701 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITGAL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6148 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P20701 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.