ITGAV

ITGAV
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JV2, 1L5G, 1M1X, 1U8C, 3IJE, 4G1E, 4G1M, 4MMX, 4MMY, 4MMZ, 4O02, 4UM8, 4UM9
Ідентифікатори
Символи	ITGAV, CD51, MSK8, VNRA, VTNR, integrin subunit alpha V
Зовнішні ІД	OMIM: 193210 MGI: 96608 HomoloGene: 20510 GeneCards: ITGAV
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transforming growth factor beta binding; • зв'язування з іоном металу; • voltage-gated calcium channel activity; • virus receptor activity; • protein kinase C binding; • protease binding; • extracellular matrix protein binding; • extracellular matrix binding; • fibronectin binding; • opsonin binding; • insulin-like growth factor I binding; • GO:0001948 protein binding; • fibroblast growth factor binding; • neuregulin binding; • coreceptor activity; • C-X3-C chemokine binding; • signaling receptor binding; • пептидний зв'язок; • integrin binding;
Клітинна компонента	• lamellipodium membrane; • integrin alphav-beta3 complex; • Екзосома; • alphav-beta3 integrin-IGF-1-IGF1R complex; • integral component of membrane; • integrin alphav-beta5 complex; • мембрана; • integrin alphav-beta8 complex; • ruffle membrane; • integrin complex; • microvillus membrane; • filopodium membrane; • external side of plasma membrane; • phagocytic vesicle; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • гіалоплазма; • focal adhesion; • Міжклітинні контакти; • specific granule membrane; • integrin alphav-beta6 complex; • alphav-beta3 integrin-PKCalpha complex; • alphav-beta3 integrin-HMGB1 complex;
Біологічний процес	• regulation of phagocytosis; • apoptotic cell clearance; • endodermal cell differentiation; • apolipoprotein A-I-mediated signaling pathway; • negative chemotaxis; • negative regulation of lipid storage; • extracellular matrix organization; • heterotypic cell-cell adhesion; • positive regulation of cell migration; • regulation of apoptotic cell clearance; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • cell-matrix adhesion; • GO:0022415 viral process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • blood vessel development; • negative regulation of entry of bacterium into host cell; • integrin-mediated signaling pathway; • calcium ion transmembrane transport; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • leukocyte migration; • cell-substrate adhesion; • negative regulation of lipoprotein metabolic process; • negative regulation of lipid transport; • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • positive regulation of cell adhesion; • ERK1 and ERK2 cascade; • cell growth; • positive regulation of osteoblast proliferation; • адгезія клітин; • Ангіогенез; • васкулогенез; • cellular calcium ion homeostasis; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • positive regulation of cell population proliferation; • cell migration; • neutrophil degranulation; • positive regulation of MAPK cascade; • cell adhesion mediated by integrin; • viral entry into host cell; • regulation of transforming growth factor beta activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3685
	16410
	ENSG00000138448
	ENSMUSG00000027087
	P06756
	P43406
	NM_001144999; NM_001145000; NM_002210
	NM_008402; NM_001398691
	NP_001138471; NP_001138472; NP_002201
	NP_032428; NP_001385620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGAV (англ. Integrin subunit alpha V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 116 038[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFPPRRRLR	LGPRGLPLLL	SGLLLPLCRA	FNLDVDSPAE	YSGPEGSYFG
FAVDFFVPSA	SSRMFLLVGA	PKANTTQPGI	VEGGQVLKCD	WSSTRRCQPI
EFDATGNRDY	AKDDPLEFKS	HQWFGASVRS	KQDKILACAP	LYHWRTEMKQ
EREPVGTCFL	QDGTKTVEYA	PCRSQDIDAD	GQGFCQGGFS	IDFTKADRVL
LGGPGSFYWQ	GQLISDQVAE	IVSKYDPNVY	SIKYNNQLAT	RTAQAIFDDS
YLGYSVAVGD	FNGDGIDDFV	SGVPRAARTL	GMVYIYDGKN	MSSLYNFTGE
QMAAYFGFSV	AATDINGDDY	ADVFIGAPLF	MDRGSDGKLQ	EVGQVSVSLQ
RASGDFQTTK	LNGFEVFARF	GSAIAPLGDL	DQDGFNDIAI	AAPYGGEDKK
GIVYIFNGRS	TGLNAVPSQI	LEGQWAARSM	PPSFGYSMKG	ATDIDKNGYP
DLIVGAFGVD	RAILYRARPV	ITVNAGLEVY	PSILNQDNKT	CSLPGTALKV
SCFNVRFCLK	ADGKGVLPRK	LNFQVELLLD	KLKQKGAIRR	ALFLYSRSPS
HSKNMTISRG	GLMQCEELIA	YLRDESEFRD	KLTPITIFME	YRLDYRTAAD
TTGLQPILNQ	FTPANISRQA	HILLDCGEDN	VCKPKLEVSV	DSDQKKIYIG
DDNPLTLIVK	AQNQGEGAYE	AELIVSIPLQ	ADFIGVVRNN	EALARLSCAF
KTENQTRQVV	CDLGNPMKAG	TQLLAGLRFS	VHQQSEMDTS	VKFDLQIQSS
NLFDKVSPVV	SHKVDLAVLA	AVEIRGVSSP	DHVFLPIPNW	EHKENPETEE
DVGPVVQHIY	ELRNNGPSSF	SKAMLHLQWP	YKYNNNTLLY	ILHYDIDGPM
NCTSDMEINP	LRIKISSLQT	TEKNDTVAGQ	GERDHLITKR	DLALSEGDIH
TLGCGVAQCL	KIVCQVGRLD	RGKSAILYVK	SLLWTETFMN	KENQNHSYSL
KSSASFNVIE	FPYKNLPIED	ITNSTLVTTN	VTWGIQPAPM	PVPVWVIILA
VLAGLLLLAV	LVFVMYRMGF	FKRVRPPQEE	QEREQLQPHE	NGEGNSET

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Donahue J.P., Sugg N., Hawiger J. (1994). The integrin alpha v gene: identification and characterization of the promoter region.. Biochim. Biophys. Acta 1219: 228 — 232. PubMed DOI:10.1016/0167-4781(94)90278-X
Cheresh D.A., Smith J.W., Cooper H.M., Quaranta V. (1989). A novel vitronectin receptor integrin (alpha v beta x) is responsible for distinct adhesive properties of carcinoma cells.. Cell 57: 59 — 69. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(89)90172-4
Joki-Korpela P., Marjomaki V., Krogerus C., Heino J., Hyypia T. (2001). Entry of human parechovirus 1.. J. Virol. 75: 1958 — 1967. PubMed DOI:10.1128/JVI.75.4.1958-1967.2001
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827
Vallon M., Essler M. (2006). Proteolytically processed soluble tumor endothelial marker (TEM) 5 mediates endothelial cell survival during angiogenesis by linking integrin alpha(v)beta3 to glycosaminoglycans.. J. Biol. Chem. 281: 34179 — 34188. PubMed DOI:10.1074/jbc.M605291200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P06756 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P06756 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.