ITGAX

ITGAX
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1N3Y, 2LUV, 3K6S, 3K71, 3K72, 4NEH, 4NEN, 5ES4
Ідентифікатори
Символи	ITGAX, CD11C, SLEB6, integrin subunit alpha X
Зовнішні ІД	OMIM: 151510 MGI: 96609 HomoloGene: 55493 GeneCards: ITGAX
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell surface; • integrin complex; • клітинна мембрана; • мембрана; • secretory granule membrane; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane;
Біологічний процес	• animal organ morphogenesis; • integrin-mediated signaling pathway; • heterotypic cell-cell adhesion; • Адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • leukocyte migration; • positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • neutrophil degranulation; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3687
	16411
	ENSG00000140678
	ENSMUSG00000030789
	P20702
	Q9QXH4
	NM_000887; NM_001286375
	NM_021334; NM_001363984; NM_001363985
	NP_000878; NP_001273304
	NP_067309; NP_001350913; NP_001350914
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGAX (англ. Integrin subunit alpha X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 163 амінокислот, а молекулярна маса — 127 829[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTRTRAALLL	FTALATSLGF	NLDTEELTAF	RVDSAGFGDS	VVQYANSWVV
VGAPQKITAA	NQTGGLYQCG	YSTGACEPIG	LQVPPEAVNM	SLGLSLASTT
SPSQLLACGP	TVHHECGRNM	YLTGLCFLLG	PTQLTQRLPV	SRQECPRQEQ
DIVFLIDGSG	SISSRNFATM	MNFVRAVISQ	FQRPSTQFSL	MQFSNKFQTH
FTFEEFRRSS	NPLSLLASVH	QLQGFTYTAT	AIQNVVHRLF	HASYGARRDA
AKILIVITDG	KKEGDSLDYK	DVIPMADAAG	IIRYAIGVGL	AFQNRNSWKE
LNDIASKPSQ	EHIFKVEDFD	ALKDIQNQLK	EKIFAIEGTE	TTSSSSFELE
MAQEGFSAVF	TPDGPVLGAV	GSFTWSGGAF	LYPPNMSPTF	INMSQENVDM
RDSYLGYSTE	LALWKGVQSL	VLGAPRYQHT	GKAVIFTQVS	RQWRMKAEVT
GTQIGSYFGA	SLCSVDVDSD	GSTDLVLIGA	PHYYEQTRGG	QVSVCPLPRG
WRRWWCDAVL	YGEQGHPWGR	FGAALTVLGD	VNGDKLTDVV	IGAPGEEENR
GAVYLFHGVL	GPSISPSHSQ	RIAGSQLSSR	LQYFGQALSG	GQDLTQDGLV
DLAVGARGQV	LLLRTRPVLW	VGVSMQFIPA	EIPRSAFECR	EQVVSEQTLV
QSNICLYIDK	RSKNLLGSRD	LQSSVTLDLA	LDPGRLSPRA	TFQETKNRSL
SRVRVLGLKA	HCENFNLLLP	SCVEDSVTPI	TLRLNFTLVG	KPLLAFRNLR
PMLAADAQRY	FTASLPFEKN	CGADHICQDN	LGISFSFPGL	KSLLVGSNLE
LNAEVMVWND	GEDSYGTTIT	FSHPAGLSYR	YVAEGQKQGQ	LRSLHLTCDS
APVGSQGTWS	TSCRINHLIF	RGGAQITFLA	TFDVSPKAVL	GDRLLLTANV
SSENNTPRTS	KTTFQLELPV	KYAVYTVVSS	HEQFTKYLNF	SESEEKESHV
AMHRYQVNNL	GQRDLPVSIN	FWVPVELNQE	AVWMDVEVSH	PQNPSLRCSS
EKIAPPASDF	LAHIQKNPVL	DCSIAGCLRF	RCDVPSFSVQ	EELDFTLKGN
LSFGWVRQIL	QKKVSVVSVA	EITFDTSVYS	QLPGQEAFMR	AQTTTVLEKY
KVHNPTPLIV	GSSIGGLLLL	ALITAVLYKV	GFFKRQYKEM	MEEANGQIAP
ENGTQTPSPP	SEK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chua G.L., Tang X.Y., Patra A.T., Tan S.M., Bhattacharjya S. (2012). Structure and binding interface of the cytosolic tails of alphaXbeta2 integrin.. PLoS ONE 7: E41924 — E41924. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0041924
Corbi A.L., Miller L.J., O'Connor K., Larson R.S., Springer T.A. (1987). cDNA cloning and complete primary structure of the alpha subunit of a leukocyte adhesion glycoprotein, p150,95.. EMBO J. 6: 4023 — 4028. PubMed
Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). Genomic structure of an integrin alpha subunit, the leukocyte p150,95 molecule.. J. Biol. Chem. 265: 2782 — 2788. PubMed
Miller L.J., Wiebe M., Springer T.A. (1987). Purification and alpha subunit N-terminal sequences of human Mac-1 and p150,95 leukocyte adhesion proteins.. J. Immunol. 138: 2381 — 2383. PubMed
Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). J. Biol. Chem. 265: 12750 — 12751.

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6152 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P20702 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6152 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P20702 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.