ITGB6

ITGB6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UM8, 4UM9
Ідентифікатори
Символи	ITGB6, AI1H, Integrin, beta 6, integrin subunit beta 6
Зовнішні ІД	OMIM: 147558 MGI: 96615 HomoloGene: 685 GeneCards: ITGB6
Пов'язані генетичні захворювання
	amelogenesis imperfecta type 1H[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• integrin binding; • virus receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integrin complex; • receptor complex; • клітинна мембрана; • мембрана; • external side of plasma membrane; • focal adhesion; • integrin alphav-beta6 complex; • Нуклеоплазма; • центросома; • Міжклітинні контакти; • cell surface;
Біологічний процес	• integrin-mediated signaling pathway; • viral entry into host cell; • cell-matrix adhesion; • inflammatory response; • Адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • GO:0022415 viral process; • cell adhesion mediated by integrin; • cell migration; • regulation of transforming growth factor beta activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3694
	16420
	ENSG00000115221
	ENSMUSG00000026971
	P18564
	Q9Z0T9
NM_000888; NM_001282353; NM_001282354; NM_001282355; NM_001282388;
	NM_001282389; NM_001282390
	NM_001159564; NM_021359
NP_000879; NP_001269282; NP_001269283; NP_001269284; NP_001269317;
	NP_001269318; NP_001269319
	NP_001153036; NP_067334
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGB6 (англ. Integrin subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 85 936[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGIELLCLFF	LFLGRNDHVQ	GGCALGGAET	CEDCLLIGPQ	CAWCAQENFT
HPSGVGERCD	TPANLLAKGC	QLNFIENPVS	QVEILKNKPL	SVGRQKNSSD
IVQIAPQSLI	LKLRPGGAQT	LQVHVRQTED	YPVDLYYLMD	LSASMDDDLN
TIKELGSRLS	KEMSKLTSNF	RLGFGSFVEK	PVSPFVKTTP	EEIANPCSSI
PYFCLPTFGF	KHILPLTNDA	ERFNEIVKNQ	KISANIDTPE	GGFDAIMQAA
VCKEKIGWRN	DSLHLLVFVS	DADSHFGMDS	KLAGIVIPND	GLCHLDSKNE
YSMSTVLEYP	TIGQLIDKLV	QNNVLLIFAV	TQEQVHLYEN	YAKLIPGATV
GLLQKDSGNI	LQLIISAYEE	LRSEVELEVL	GDTEGLNLSF	TAICNNGTLF
QHQKKCSHMK	VGDTASFSVT	VNIPHCERRS	RHIIIKPVGL	GDALELLVSP
ECNCDCQKEV	EVNSSKCHHG	NGSFQCGVCA	CHPGHMGPRC	ECGEDMLSTD
SCKEAPDHPS	CSGRGDCYCG	QCICHLSPYG	NIYGPYCQCD	NFSCVRHKGL
LCGGNGDCDC	GECVCRSGWT	GEYCNCTTST	DSCVSEDGVL	CSGRGDCVCG
KCVCTNPGAS	GPTCERCPTC	GDPCNSKRSC	IECHLSAAGQ	AREECVDKCK
LAGATISEEE	DFSKDGSVSC	SLQGENECLI	TFLITTDNEG	KTIIHSINEK
DCPKPPNIPM	IMLGVSLAIL	LIGVVLLCIW	KLLVSFHDRK	EVAKFEAERS
KAKWQTGTNP	LYRGSTSTFK	NVTYKHREKQ	KVDLSTDC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Gianni T., Salvioli S., Chesnokova L.S., Hutt-Fletcher L.M., Campadelli-Fiume G. (2013). alphavbeta6- and alphavbeta8-integrins serve as interchangeable receptors for HSV gH/gL to promote endocytosis and activation of membrane fusion.. PLoS Pathog. 9: E1003806 — E1003806. PubMed DOI:10.1371/journal.ppat.1003806

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з ITGB6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6161 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P18564 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITGB6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6161 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P18564 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.