ITK

ITK
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SM2, 1SNU, 1SNX, 2E6I, 2LMJ, 2YUQ, 3MIY, 3MJ1, 3MJ2, 3QGW, 3QGY, 3T9T, 3V5J, 3V5L, 3V8T, 3V8W, 4HCT, 4HCU, 4HCV, 4KIO, 4L7S, 4M0Y, 4M0Z, 4M12, 4M13, 4M14, 4M15, 4MF0, 4MF1, 4PP9, 4PPA, 4PPB, 4PPC, 4PQN, 4QD6, 4RFM
Ідентифікатори
Символи	ITK, EMT, LPFS1, LYK, PSCTK2, IL2 inducible T-cell kinase, IL2 inducible T cell kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 186973 MGI: 96621 HomoloGene: 4051 GeneCards: ITK
Пов'язані генетичні захворювання
	lymphoproliferative syndrome 1[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • protein tyrosine kinase activity; • signaling receptor binding; • ATP binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cell-cell junction; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • adaptive immune response; • фосфорилювання; • NK T cell differentiation; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • immune system process; • cytokine production; • activation of phospholipase C activity; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • protein phosphorylation; • cellular defense response; • regulation of cell population proliferation; • peptidyl-tyrosine autophosphorylation; • T cell receptor signaling pathway; • T cell activation; • Сигнальна трансдукція; • interleukin-4 production; • Вроджений імунітет; • B cell receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3702
	16428
	ENSG00000113263
	ENSMUSG00000020395
	Q08881
	Q03526
	NM_005546
	NM_001281965; NM_001281966; NM_001281967; NM_001281968; NM_010583
	NP_005537
	NP_001268894; NP_001268895; NP_001268896; NP_001268897; NP_034713
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITK (англ. IL2 inducible T-cell kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 71 831[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNNFILLEEQ	LIKKSQQKRR	TSPSNFKVRF	FVLTKASLAY	FEDRHGKKRT
LKGSIELSRI	KCVEIVKSDI	SIPCHYKYPF	QVVHDNYLLY	VFAPDRESRQ
RWVLALKEET	RNNNSLVPKY	HPNFWMDGKW	RCCSQLEKLA	TGCAQYDPTK
NASKKPLPPT	PEDNRRPLWE	PEETVVIALY	DYQTNDPQEL	ALRRNEEYCL
LDSSEIHWWR	VQDRNGHEGY	VPSSYLVEKS	PNNLETYEWY	NKSISRDKAE
KLLLDTGKEG	AFMVRDSRTA	GTYTVSVFTK	AVVSENNPCI	KHYHIKETND
NPKRYYVAEK	YVFDSIPLLI	NYHQHNGGGL	VTRLRYPVCF	GRQKAPVTAG
LRYGKWVIDP	SELTFVQEIG	SGQFGLVHLG	YWLNKDKVAI	KTIREGAMSE
EDFIEEAEVM	MKLSHPKLVQ	LYGVCLEQAP	ICLVFEFMEH	GCLSDYLRTQ
RGLFAAETLL	GMCLDVCEGM	AYLEEACVIH	RDLAARNCLV	GENQVIKVSD
FGMTRFVLDD	QYTSSTGTKF	PVKWASPEVF	SFSRYSSKSD	VWSFGVLMWE
VFSEGKIPYE	NRSNSEVVED	ISTGFRLYKP	RLASTHVYQI	MNHCWKERPE
DRPAFSRLLR	QLAEIAESGL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Tanaka N., Asao H., Ohtani K., Nakamura M., Sugamura K. (1993). A novel human tyrosine kinase gene inducible in T cells by interleukin 2.. FEBS Lett. 324: 1 — 5. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(93)81520-A
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Heyeck S.D., Wilcox H.M., Bunnell S.C., Berg L.J. (1997). Lck phosphorylates the activation loop tyrosine of the Itk kinase domain and activates Itk kinase activity.. J. Biol. Chem. 272: 25401 — 25408. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.40.25401
King P.D., Sadra A., Teng J.M., Bell G.M., Dupont B. (1998). CD2-mediated activation of the Tec-family tyrosine kinase ITK is controlled by proline-rich stretch-4 of the CD2 cytoplasmic tail.. Int. Immunol. 10: 1009 — 1016. PubMed DOI:10.1093/intimm/10.7.1009
Yang W.C., Collette Y., Nunes J.A., Olive D. (2000). Tec kinases: a family with multiple roles in immunity.. Immunity 12: 373 — 382. PubMed DOI:10.1016/S1074-7613(00)80189-2
Grasis J.A., Browne C.D., Tsoukas C.D. (2003). Inducible T cell tyrosine kinase regulates actin-dependent cytoskeletal events induced by the T cell antigen receptor.. J. Immunol. 170: 3971 — 3976. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.170.8.3971

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з ITK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6171 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, Q08881 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6171 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q08881 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.