LBP

LBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4M4D
Ідентифікатори
Символи	LBP, BPIFD2, lipopolysaccharide binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 151990 MGI: 1098776 HomoloGene: 3055 GeneCards: LBP
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipoteichoic acid binding; • GO:0001948 protein binding; • lipid binding; • signaling receptor binding; • lipopolysaccharide binding; • ліпопептидний зв'язок;
Клітинна компонента	• мембрана; • Екзосома; • extracellular region; • cell surface; • extracellular space;
Біологічний процес	• detection of molecule of bacterial origin; • lipid transport; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • immune system process; • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response; • cellular defense response; • cellular response to lipoteichoic acid; • defense response to bacterium; • lipopolysaccharide transport; • positive regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • positive regulation of chemokine production; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • Опсонізація; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • response to lipopolysaccharide; • macrophage activation involved in immune response; • positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response; • acute-phase response; • Вроджений імунітет; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of macrophage activation; • toll-like receptor signaling pathway; • macromolecule localization; • positive regulation of cytolysis; • транспорт; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3929
	16803
	ENSG00000129988
	ENSMUSG00000016024
	P18428
	Q61805
	NM_004139
	NM_008489
	NP_004130
	NP_032515
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LBP (англ. Lipopolysaccharide binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 53 384[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGALARALPS	ILLALLLTST	PEALGANPGL	VARITDKGLQ	YAAQEGLLAL
QSELLRITLP	DFTGDLRIPH	VGRGRYEFHS	LNIHSCELLH	SALRPVPGQG
LSLSISDSSI	RVQGRWKVRK	SFFKLQGSFD	VSVKGISISV	NLLLGSESSG
RPTVTASSCS	SDIADVEVDM	SGDLGWLLNL	FHNQIESKFQ	KVLESRICEM
IQKSVSSDLQ	PYLQTLPVTT	EIDSFADIDY	SLVEAPRATA	QMLEVMFKGE
IFHRNHRSPV	TLLAAVMSLP	EEHNKMVYFA	ISDYVFNTAS	LVYHEEGYLN
FSITDDMIPP	DSNIRLTTKS	FRPFVPRLAR	LYPNMNLELQ	GSVPSAPLLN
FSPGNLSVDP	YMEIDAFVLL	PSSSKEPVFR	LSVATNVSAT	LTFNTSKITG
FLKPGKVKVE	LKESKVGLFN	AELLEALLNY	YILNTFYPKF	NDKLAEGFPL
PLLKRVQLYD	LGLQIHKDFL	FLGANVQYMR	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транспорт, транспорт ліпідів. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Hubacek J.A., Buchler C., Aslanidis C., Schmitz G. (1997). The genomic organization of the genes for human lipopolysaccharide binding protein (LBP) and bactericidal permeability increasing protein (BPI) is highly conserved.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 236: 427 — 430. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1997.6970
Wright S.D., Ramos R.A., Tobias P.S., Ulevitch R.J., Mathison J.C. (1990). CD14, a receptor for complexes of lipopolysaccharide (LPS) and LPS binding protein.. Science 249: 1431 — 1433. PubMed DOI:10.1126/science.1698311
Jerala R. (2007). Structural biology of the LPS recognition.. Int. J. Med. Microbiol. 297: 353 — 363. PubMed DOI:10.1016/j.ijmm.2007.04.001
Tsukamoto H., Fukudome K., Takao S., Tsuneyoshi N., Kimoto M. (2010). Lipopolysaccharide-binding protein-mediated Toll-like receptor 4 dimerization enables rapid signal transduction against lipopolysaccharide stimulation on membrane-associated CD14-expressing cells.. Int. Immunol. 22: 271 — 280. PubMed DOI:10.1093/intimm/dxq005
Long J.Y., Liu J.Q., Xue Y.N., Wang H.X. (1998). Cloning and sequencing of human lipopolysaccharide-binding protein gene.. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Jin Zhan 25: 469 — 471.

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6517 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P18428 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6517 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P18428 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.