LPP

LPP
Ідентифікатори
Символи	LPP, LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma
Зовнішні ІД	OMIM: 600700 MGI: 2441849 HomoloGene: 4075 GeneCards: LPP
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, Вітиліго, натуральна віспа, целіакія[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• Міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • мембрана; • клітинне ядро; • focal adhesion; • цитоплазма; • гіалоплазма; • stress fiber;
Біологічний процес	• Адгезія клітин; • життєдіяльність; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4026
	210126
	ENSG00000145012
	ENSMUSG00000033306
	Q93052
	Q8BFW7
NM_001167671; NM_001167672; NM_005578; NM_001375455; NM_001375456;
	NM_001375457; NM_001375458; NM_001375459; NM_001375460; NM_001375461; NM_001375462; NM_001375463; NM_001375464; NM_001375465
	NM_001145952; NM_001145954; NM_178665
NP_001161143; NP_001161144; NP_005569; NP_001362384; NP_001362385;
	NP_001362386; NP_001362387; NP_001362388; NP_001362389; NP_001362390; NP_001362391; NP_001362392; NP_001362393; NP_001362394
	NP_001139424; NP_001139426; NP_848780
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LPP (англ. LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 65 746[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHPSWLPPK	STGEPLGHVP	ARMETTHSFG	NPSISVSTQQ	PPKKFAPVVA
PKPKYNPYKQ	PGGEGDFLPP	PPPPLDDSSA	LPSISGNFPP	PPPLDEEAFK
VQGNPGGKTL	EERRSSLDAE	IDSLTSILAD	LECSSPYKPR	PPQSSTGSTA
SPPVSTPVTG	HKRMVIPNQP	PLTATKKSTL	KPQPAPQAGP	IPVAPIGTLK
PQPQPVPASY	TTASTSSRPT	FNVQVKSAQP	SPHYMAAPSS	GQIYGSGPQG
YNTQPVPVSG	QCPPPSTRGG	MDYAYIPPPG	LQPEPGYGYA	PNQGRYYEGY
YAAGPGYGGR	NDSDPTYGQQ	GHPNTWKREP	GYTPPGAGNQ	NPPGMYPVTG
PKKTYITDPV	SAPCAPPLQP	KGGHSGQLGP	SSVAPSFRPE	DELEHLTKKM
LYDMENPPAD	EYFGRCARCG	ENVVGEGTGC	TAMDQVFHVD	CFTCIICNNK
LRGQPFYAVE	KKAYCEPCYI	NTLEQCNVCS	KPIMERILRA	TGKAYHPHCF
TCVMCHRSLD	GIPFTVDAGG	LIHCIEDFHK	KFAPRCSVCK	EPIMPAPGQE
ETVRIVALDR	DFHVHCYRCE	DCGGLLSEGD	NQGCYPLDGH	ILCKTCNSAR
IRVLTAKAST	DL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Petit M.M.R., Mols R., Schoenmakers E.F., Mandahl N., Van de Ven W.J.M. (1996). LPP, the preferred fusion partner gene of HMGIC in lipomas, is a novel member of the LIM protein gene family.. Genomics 36: 118 — 129. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.0432
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Petit M.M., Swarts S., Bridge J.A., Van de Ven W.J.M. (1998). Expression of reciprocal fusion transcripts of the HMGIC and LPP genes in parosteal lipoma.. Cancer Genet. Cytogenet. 106: 18 — 23. PubMed DOI:10.1016/S0165-4608(98)00038-7
Rogalla P., Lemke I., Kazmierczak B., Bullerdiek J. (2000). An identical HMGIC-LPP fusion transcript is consistently expressed in pulmonary chondroid hamartomas with t(3;12)(q27-28;q14-15).. Genes Chromosomes Cancer 29: 363 — 366. PubMed DOI:10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<1::AID-GCC1043>3.3.CO;2-E
Petit M.M., Meulemans S.M., Van de Ven W.J.M. (2003). The focal adhesion and nuclear targeting capacity of the LIM-containing lipoma-preferred partner (LPP) protein.. J. Biol. Chem. 278: 2157 — 2168. PubMed DOI:10.1074/jbc.M206106200
Li B., Zhuang L., Reinhard M., Trueb B. (2003). The lipoma preferred partner LPP interacts with alpha-actinin.. J. Cell Sci. 116: 1359 — 1366. PubMed DOI:10.1242/jcs.00309

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LPP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6679 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q93052 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LPP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6679 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q93052 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.