LRRTM1

LRRTM1
Ідентифікатори
Символи	LRRTM1, entrez:347730, leucine rich repeat transmembrane neuronal 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610867 MGI: 2389173 HomoloGene: 41763 GeneCards: LRRTM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase inhibitor activity; • молекулярна функція;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • postsynaptic membrane; • мембрана; • growth cone; • клітинна мембрана; • Синапс; • excitatory synapse; • cell surface; • Аксон; • Міжклітинні контакти; • Ендоплазматичний ретикулум; • extracellular space; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of postsynaptic specialization membrane;
Біологічний процес	• locomotory behavior; • negative regulation of protein kinase activity; • cytokine-mediated signaling pathway; • negative regulation of receptor internalization; • synapse organization; • exploration behavior; • protein localization to synapse; • long-term synaptic potentiation; • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; • positive regulation of synapse assembly; • життєдіяльність; • regulation of postsynaptic density assembly; • regulation of presynapse assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	347730
	74342
	ENSG00000162951
	ENSMUSG00000060780
	Q86UE6
	Q8K377
	NM_178839
	NM_028880; NM_001362109
	NP_849161
	NP_083156; NP_001349038
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LRRTM1 (англ. Leucine rich repeat transmembrane neuronal 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 58 641[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFLLLGLCL	YWLLRRPSGV	VLCLLGACFQ	MLPAAPSGCP	QLCRCEGRLL
YCEALNLTEA	PHNLSGLLGL	SLRYNSLSEL	RAGQFTGLMQ	LTWLYLDHNH
ICSVQGDAFQ	KLRRVKELTL	SSNQITQLPN	TTFRPMPNLR	SVDLSYNKLQ
ALAPDLFHGL	RKLTTLHMRA	NAIQFVPVRI	FQDCRSLKFL	DIGYNQLKSL
ARNSFAGLFK	LTELHLEHND	LVKVNFAHFP	RLISLHSLCL	RRNKVAIVVS
SLDWVWNLEK	MDLSGNEIEY	MEPHVFETVP	HLQSLQLDSN	RLTYIEPRIL
NSWKSLTSIT	LAGNLWDCGR	NVCALASWLN	NFQGRYDGNL	QCASPEYAQG
EDVLDAVYAF	HLCEDGAEPT	SGHLLSAVTN	RSDLGPPASS	ATTLADGGEG
QHDGTFEPAT	VALPGGEHAE	NAVQIHKVVT	GTMALIFSFL	IVVLVLYVSW
KCFPASLRQL	RQCFVTQRRK	QKQKQTMHQM	AAMSAQEYYV	DYKPNHIEGA
LVIINEYGSC	TCHQQPAREC	EV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Lauren J., Airaksinen M.S., Saarma M., Timmusk T.T. (2003). A novel gene family encoding leucine-rich repeat transmembrane proteins differentially expressed in the nervous system.. Genomics 81: 411 — 421. PubMed DOI:10.1016/S0888-7543(03)00030-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19408 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q86UE6 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19408 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86UE6 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.