LSM11

LSM11
Ідентифікатори
Символи	LSM11, U7 small nuclear RNA associated, AGS8
Зовнішні ІД	OMIM: 617910 MGI: 1919540 HomoloGene: 32693 GeneCards: LSM11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• U7 snRNA binding; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• U7 snRNP; • histone pre-mRNA 3'end processing complex; • клітинне ядро; • telomerase holoenzyme complex; • Нуклеоплазма; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA processing; • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage; • histone mRNA metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	134353
	72290
	ENSG00000155858
	ENSMUSG00000044847
	P83369
	Q8BUV6
	NM_173491
	NM_028185
	NP_775762
	NP_082461
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LSM11 (англ. LSM11, U7 small nuclear RNA associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 39 500[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEERERGARS	AGAGSPARPP	SPRLDVSSDS	FDPLLALYAP	RLPPIPYPNA
PCFNNVAEYE	SFLRTGVRGG	GRGRGRARGA	AAGSGVPAAP	GPSGRTRRRP
DAPAPDPERI	QRLRRLMVAK	EEGDGAAGAG	RRGPGRSRKA	PRNVLTRMPL
HEGSPLGELH	RCIREGVKVN	VHIRTFKGLR	GVCTGFLVAF	DKFWNMALTD
VDETYRKPVL	GKAYERDSSL	TLTRLFDRLK	LQDSSKKEAD	SKSAVEDSTL
SRYSQTSTWK	LASVWGRADT	GRGSHKRSRS	VPSSLQASAR	EESRSELSGR
TTRTDGSSVG	GTFSRATTLS	RGQSRKKKRK	PKVDYQQVFT	RHINQIFIRG
ENVLLVHLAQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein.. EMBO J. 20: 5470 — 5479. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase.. Mol. Cell. Biol. 26: 6702 — 6712. PubMed DOI:10.1128/MCB.00391-06

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30860 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
UniProt, P83369 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30860 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P83369 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.