LY96

LY96
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E56, 2E59, 2Z65, 3FXI, 3ULA, 4G8A
Ідентифікатори
Символи	LY96, ESOP-1, MD-2, MD2, ly-96, lymphocyte antigen 96
Зовнішні ІД	OMIM: 605243 MGI: 1341909 HomoloGene: 9109 GeneCards: LY96
Онтологія гена
Молекулярна функція	• coreceptor activity; • GO:0001948 protein binding; • lipopolysaccharide immune receptor activity; • lipopolysaccharide binding; • Toll-like receptor 4 binding;
Клітинна компонента	• intrinsic component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • extracellular region; • lipopolysaccharide receptor complex; • endosome membrane; • extracellular space;
Біологічний процес	• toll-like receptor 4 signaling pathway; • immune system process; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • cellular defense response; • cell surface receptor signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • detection of lipopolysaccharide; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • Вроджений імунітет; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • apoptotic signaling pathway; • toll-like receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23643
	17087
	ENSG00000154589
	ENSMUSG00000025779
	Q9Y6Y9
	Q9JHF9
	NM_001195797; NM_015364
	NM_001159711; NM_016923
	NP_001182726; NP_056179
	NP_001153183; NP_058619
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LY96 (англ. Lymphocyte antigen 96) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 160 амінокислот, а молекулярна маса — 18 546[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPFLFFSTL	FSSIFTEAQK	QYWVCNSSDA	SISYTYCDKM	QYPISINVNP
CIELKRSKGL	LHIFYIPRRD	LKQLYFNLYI	TVNTMNLPKR	KEVICRGSDD
DYSFCRALKG	ETVNTTISFS	FKGIKFSKGK	YKCVVEAISG	SPEEMLFCLE
FVILHQPNSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
da Silva Correia J., Soldau K., Christen U., Tobias P.S., Ulevitch R.J. (2001). Lipopolysaccharide is in close proximity to each of the proteins in its membrane receptor complex. transfer from CD14 to TLR4 and MD-2.. J. Biol. Chem. 276: 21129 — 21135. PubMed DOI:10.1074/jbc.M009164200
Dziarski R., Wang Q., Miyake K., Kirschning C.J., Gupta D. (2001). MD-2 enables Toll-like receptor 2 (TLR2)-mediated responses to lipopolysaccharide and enhances TLR2-mediated responses to Gram-positive and Gram-negative bacteria and their cell wall components.. J. Immunol. 166: 1938 — 1944. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.166.3.1938
Visintin A., Mazzoni A., Spitzer J.A., Segal D.M. (2001). Secreted MD-2 is a large polymeric protein that efficiently confers lipopolysaccharide sensitivity to Toll-like receptor 4.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12156 — 12161. PubMed DOI:10.1073/pnas.211445098
Ohto U., Fukase K., Miyake K., Satow Y. (2007). Crystal structures of human MD-2 and its complex with antiendotoxic lipid IVa.. Science 316: 1632 — 1634. PubMed DOI:10.1126/science.1139111
Kato K., Morrison A.M., Nakano T., Tashiro K., Honjo T. (2000). ESOP-1, a secreted protein expressed in the hematopoietic, nervous, and reproductive systems of embryonic and adult mice.. Blood 96: 362 — 364. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17156 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, Q9Y6Y9 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17156 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y6Y9 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.