MFGE8

MFGE8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L9L
Ідентифікатори
Символи	MFGE8, milk fat globule-EGF factor 8 protein, BA46, EDIL1, HMFG, HsT19888, MFG-E8, MFGM, OAcGD3S, SED1, SPAG10, hP47, milk fat globule EGF and factor V/VIII domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 602281 MGI: 102768 HomoloGene: 4334 GeneCards: MFGE8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylserine binding; • phosphatidylethanolamine binding; • integrin binding; • extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• external side of plasma membrane; • extrinsic component of plasma membrane; • extracellular region; • Екзосома; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular vesicle; • мембрана; • extracellular space; • endoplasmic reticulum lumen; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular protein metabolic process; • phagocytosis, recognition; • Ангіогенез; • positive regulation of phagocytosis; • positive regulation of apoptotic cell clearance; • phagocytosis, engulfment; • Адгезія клітин; • single fertilization; • GO:0022415 viral process; • посттрансляційна модифікація; • apoptotic cell clearance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4240
	17304
	ENSG00000140545
	ENSMUSG00000030605
	Q08431
	P21956
	NM_001114614; NM_001310319; NM_001310320; NM_001310321; NM_005928
	NM_001045489; NM_008594
	NP_001108086; NP_001297248; NP_001297249; NP_001297250; NP_005919
	NP_001038954; NP_032620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MFGE8 (англ. Milk fat globule-EGF factor 8 protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 43 123[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRPRLLAAL	CGALLCAPSL	LVALDICSKN	PCHNGGLCEE	ISQEVRGDVF
PSYTCTCLKG	YAGNHCETKC	VEPLGMENGN	IANSQIAASS	VRVTFLGLQH
WVPELARLNR	AGMVNAWTPS	SNDDNPWIQV	NLLRRMWVTG	VVTQGASRLA
SHEYLKAFKV	AYSLNGHEFD	FIHDVNKKHK	EFVGNWNKNA	VHVNLFETPV
EAQYVRLYPT	SCHTACTLRF	ELLGCELNGC	ANPLGLKNNS	IPDKQITASS
SYKTWGLHLF	SWNPSYARLD	KQGNFNAWVA	GSYGNDQWLQ	VDLGSSKEVT
GIITQGARNF	GSVQFVASYK	VAYSNDSANW	TEYQDPRTGS	SKIFPGNWDN
HSHKKNLFET	PILARYVRIL	PVAWHNRIAL	RLELLGC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, запліднення, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Couto J.R., Taylor M.R., Godwin S.G., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1996). Cloning and sequence analysis of human breast epithelial antigen BA46 reveals an RGD cell adhesion sequence presented on an epidermal growth factor-like domain.. DNA Cell Biol. 15: 281 — 286. PubMed DOI:10.1089/dna.1996.15.281
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Giuffrida M.G., Cavaletto M., Giunta C., Conti A., Godovac-Zimmermann J. (1998). Isolation and characterization of full and truncated forms of human breast carcinoma protein BA46 from human milk fat globule membranes.. J. Protein Chem. 17: 143 — 148. PubMed DOI:10.1023/A:1022531500370
Taylor M.R., Couto J.R., Scallan C.D., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1997). Lactadherin (formerly BA46), a membrane-associated glycoprotein expressed in human milk and breast carcinomas, promotes Arg-Gly-Asp (RGD)-dependent cell adhesion.. DNA Cell Biol. 16: 861 — 869. PubMed DOI:10.1089/dna.1997.16.861
Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry.. Proteomics 8: 3833 — 3847. PubMed DOI:10.1002/pmic.200701057
Raymond A., Ensslin M.A., Shur B.D. (2009). SED1/MFG-E8: a bi-motif protein that orchestrates diverse cellular interactions.. J. Cell. Biochem. 106: 957 — 966. PubMed DOI:10.1002/jcb.22076

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7036 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q08431 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7036 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q08431 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.