MMP7

MMP7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MMQ, 1MMR, 2MZE, 2DDY, 2Y6C, 2MZH, 1MMP, 2Y6D
Ідентифікатори
Символи	MMP7, MMP-7, MPSL1, PUMP-1, matrix metallopeptidase 7
Зовнішні ІД	OMIM: 178990 MGI: 103189 HomoloGene: 37619 GeneCards: MMP7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • peptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • hydrolase activity; • serine-type endopeptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • metallopeptidase activity;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • cell surface; • Екзосома; • extracellular space;
Біологічний процес	• maternal process involved in female pregnancy; • еструс; • Старіння людини; • extracellular matrix disassembly; • cellular response to mechanical stimulus; • response to nutrient levels; • collagen catabolic process; • Протеоліз; • antibacterial peptide secretion; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4316
	17393
	ENSG00000137673
	ENSMUSG00000018623
	P09237
	Q10738; Q3UN27
	NM_002423
	NM_010810; NM_001319986
	NP_002414
	NP_001306915; NP_034940
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MMP7 (англ. Matrix metallopeptidase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 267 амінокислот, а молекулярна маса — 29 677[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLTVLCAVC	LLPGSLALPL	PQEAGGMSEL	QWEQAQDYLK	RFYLYDSETK
NANSLEAKLK	EMQKFFGLPI	TGMLNSRVIE	IMQKPRCGVP	DVAEYSLFPN
SPKWTSKVVT	YRIVSYTRDL	PHITVDRLVS	KALNMWGKEI	PLHFRKVVWG
TADIMIGFAR	GAHGDSYPFD	GPGNTLAHAF	APGTGLGGDA	HFDEDERWTD
GSSLGINFLY	AATHELGHSL	GMGHSSDPNA	VMYPTYGNGD	PQNFKLSQDD
IKGIQKLYGK	RSNSRKK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Marti H.P., McNeil L., Thomas G., Davies M., Lovett D.H. (1992). Molecular characterization of a low-molecular-mass matrix metalloproteinase secreted by glomerular mesangial cells as PUMP-1.. Biochem. J. 285: 899 — 905. PubMed DOI:10.1042/bj2850899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Quantin B., Murphy G., Breathnach R. (1989). Pump-1 cDNA codes for a protein with characteristics similar to those of classical collagenase family members.. Biochemistry 28: 5327 — 5334. PubMed DOI:10.1021/bi00439a004
Browner M.F., Smith W.W., Castelhano A.L. (1995). Matrilysin-inhibitor complexes: common themes among metalloproteases.. Biochemistry 34: 6602 — 6610. PubMed DOI:10.1021/bi00020a004
Miyazaki K., Hattori Y., Umenishi F., Yasumitsu H., Umeda M. (1990). Purification and characterization of extracellular matrix-degrading metalloproteinase, matrin (pump-1), secreted from human rectal carcinoma cell line.. Cancer Res. 50: 7758 — 7764. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7174 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P09237 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7174 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P09237 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.