MS4A1

MS4A1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3PP4, 2OSL, 3BKY
Ідентифікатори
Символи	MS4A1, B1, Bp35, CD20, CVID5, LEU-16, MS4A2, S7, membrane spanning 4-domains A1, FMC7
Зовнішні ІД	OMIM: 112210 MGI: 88321 HomoloGene: 7259 GeneCards: MS4A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• epidermal growth factor receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • MHC class II protein complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • Екзосома; • мембрана; • external side of plasma membrane; • extracellular space; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• B cell activation; • B cell proliferation; • humoral immune response; • response to bacterium;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	931
	12482
	ENSG00000156738
	ENSMUSG00000024673
	P11836
	P19437
	NM_152866; NM_021950; NM_152867
	NM_007641
	NP_068769; NP_690605; NP_690606
	NP_031667
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MS4A1 (англ. Membrane spanning 4-domains A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 297 амінокислот, а молекулярна маса — 33 077[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTTPRNSVNG	TFPAEPMKGP	IAMQSGPKPL	FRRMSSLVGP	TQSFFMRESK
TLGAVQIMNG	LFHIALGGLL	MIPAGIYAPI	CVTVWYPLWG	GIMYIISGSL
LAATEKNSRK	CLVKGKMIMN	SLSLFAAISG	MILSIMDILN	IKISHFLKME
SLNFIRAHTP	YINIYNCEPA	NPSEKNSPST	QYCYSIQSLF	LGILSVMLIF
AFFQELVIAG	IVENEWKRTC	SRPKSNIVLL	SAEEKKEQTI	EIKEEVVGLT
ETSSQPKNEE	DIEIIPIQEE	EEEETETNFP	EPPQDQESSP	IENDSSP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Stamenkovic I., Seed B. (1988). Analysis of two cDNA clones encoding the B lymphocyte antigen CD20 (B1, Bp35), a type III integral membrane protein.. J. Exp. Med. 167: 1975 — 1980. PubMed DOI:10.1084/jem.167.6.1975
Tedder T.F., Streuli M., Schlossman S.F., Saito H. (1988). Isolation and structure of a cDNA encoding the B1 (CD20) cell-surface antigen of human B lymphocytes.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 208 — 212. PubMed DOI:10.1073/pnas.85.1.208
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment.. J. Proteome Res. 7: 5167 — 5176. PubMed DOI:10.1021/pr800500r
Einfeld D.A., Brown J.P., Valentine M.A., Clark E.A., Ledbetter J.A. (1988). Molecular cloning of the human B cell CD20 receptor predicts a hydrophobic protein with multiple transmembrane domains.. EMBO J. 7: 711 — 717. PubMed
Tedder T.F., Klejman G., Schlossman S.F., Saito H. (1989). Structure of the gene encoding the human B lymphocyte differentiation antigen CD20 (B1).. J. Immunol. 142: 2560 — 2568. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7315 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P11836 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7315 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P11836 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.