MUC1

MUC1
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: P15941%20or%20A5YRU7%20or%20B6ECB3%20or%20Q7Z551%20or%20A6ZIE3 PDBe P15941,A5YRU7,B6ECB3,Q7Z551,A6ZIE3 RCSB
Список кодів PDB
	1SM3, 2ACM
Ідентифікатори
Символи	MUC1, ADMCKD, ADMCKD1, CA 15-3, CD227, EMA, H23AG, KL-6, MAM6, MCD, MCKD, MCKD1, MUC-1, MUC-1/SEC, MUC-1/X, MUC1/ZD, PEM, PEMT, PUM, mucin 1, cell surface associated, ADTKD2, Ca15-3
Зовнішні ІД	OMIM: 158340 HomoloGene: 136477 GeneCards: MUC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • p53 binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • цитоплазма; • integral component of membrane; • клітинне ядро; • Golgi lumen; • integral component of plasma membrane; • apical plasma membrane; • мембрана; • везикула; • Екзосома; • extracellular space; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• positive regulation of histone H4 acetylation; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress; • O-glycan processing; • negative regulation of transcription by competitive promoter binding; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4582
	н/д
	ENSG00000185499
	н/д
	Q7Z551
	н/д
NM_001018016; NM_001018017; NM_001018021; NM_001044390; NM_001044391;
	NM_001044392; NM_001044393; NM_001204285; NM_001204286; NM_001204287; NM_001204288; NM_001204289; NM_001204290; NM_001204291; NM_001204292; NM_001204293; NM_001204294; NM_001204295; NM_001204296; NM_001204297; NM_002456; NM_182741; NM_001371720
	н/д
NP_001018016; NP_001018017; NP_001037855; NP_001037856; NP_001037857;
	NP_001037858; NP_001191214; NP_001191215; NP_001191216; NP_001191217; NP_001191218; NP_001191219; NP_001191220; NP_001191221; NP_001191222; NP_001191223; NP_001191224; NP_001191225; NP_001191226; NP_002447; NP_001358649; NP_001191217.1; NP_001191225.1; NP_001037856.1
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

MUC1 — ген, що кодує білок Mucin-1 і розташований у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга кодованого геном білка становить 1 255 амінокислот, а молекулярна маса — 122 102[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPGTQSPFF	LLLLLTVLTV	VTGSGHASST	PGGEKETSAT	QRSSVPSSTE
KNAVSMTSSV	LSSHSPGSGS	STTQGQDVTL	APATEPASGS	AATWGQDVTS
VPVTRPALGS	TTPPAHDVTS	APDNKPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS
TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS
APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDTRPAPGS	TAPPAHGVTS	APDNRPALGS
TAPPVHNVTS	ASGSASGSAS	TLVHNGTSAR	ATTTPASKST	PFSIPSHHSD
TPTTLASHST	KTDASSTHHS	SVPPLTSSNH	STSPQLSTGV	SFFFLSFHIS
NLQFNSSLED	PSTDYYQELQ	RDISEMFLQI	YKQGGFLGLS	NIKFRPGSVV
VQLTLAFREG	TINVHDVETQ	FNQYKTEAAS	RYNLTISDVS	VSDVPFPFSA
QSGAGVPGWG	IALLVLVCVL	VALAIVYLIA	LAVCQCRRKN	YGQLDIFPAR
DTYHPMSEYP	TYHTHGRYVP	PSSTDRSPYE	KVSAGNGGSS	LSYTNPAVAA
TSANL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Oosterkamp H.M., Scheiner L., Stefanova M.C., Lloyd K.O., Finstad C.L. (1997). Comparison of MUC-1 mucin expression in epithelial and non-epithelial cancer cell lines and demonstration of a new short variant form (MUC-1/Z).. Int. J. Cancer 72: 87 — 94. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19970703)72:1<87::AID-IJC13>3.0.CO;2-7
Zhang L., Vlad A., Milcarek C., Finn O.J. (2013). Human mucin MUC1 RNA undergoes different types of alternative splicing resulting in multiple isoforms.. Cancer Immunol. Immunother. 62: 423 — 435. PubMed DOI:10.1007/s00262-012-1325-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Abe M., Siddiqui J., Kufe D. (1989). Sequence analysis of the 5' region of the human DF3 breast carcinoma-associated antigen gene.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 165: 644 — 649. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(89)80014-2
Weiss M., Baruch A., Keydar I., Wreschner D.H. (1996). Preoperative diagnosis of thyroid papillary carcinoma by reverse transcriptase polymerase chain reaction of the MUC1 gene.. Int. J. Cancer 66: 55 — 59. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19960328)66:1<55::AID-IJC10>3.0.CO;2-A
Zrihan-Licht S., Baruch A., Elroy-Stein O., Keydar I., Wreschner D.H. (1994). Tyrosine phosphorylation of the MUC1 breast cancer membrane proteins. Cytokine receptor-like molecules.. FEBS Lett. 356: 130 — 136. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(94)01251-2

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7508 (англ.). Процитовано 20 грудня 2016.
UniProt, P15941 (англ.). Процитовано 20 грудня 2016.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7508 (англ.). Процитовано 20 грудня 2016.

[UniProt-3] UniProt, P15941 (англ.). Процитовано 20 грудня 2016.