MYB

MYB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GUU, 1GV2, 1GV5, 1GVD, 1H88, 1H89, 1IDY, 1IDZ, 1MBE, 1MBF, 1MBG, 1MBH, 1MBJ, 1MBK, 1MSE, 1MSF, 1SB0, 2AGH
Ідентифікатори
Символи	MYB, Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, MYB proto-oncogene, transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 189990 MGI: 97249 HomoloGene: 31311 GeneCards: MYB
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• nuclear matrix; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of transcription, DNA-templated; • Ремоделювання хроматину; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of histone H3-K4 methylation; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of histone H3-K9 methylation; • positive regulation of T-helper cell differentiation; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0007067 мітоз; • response to hypoxia; • positive regulation of collagen biosynthetic process; • positive regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of glial cell proliferation; • cellular response to hydrogen peroxide; • cellular response to retinoic acid; • positive regulation of transforming growth factor beta production; • positive regulation of neuron death; • positive regulation of hepatic stellate cell proliferation; • positive regulation of hepatic stellate cell activation; • positive regulation of testosterone secretion; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4602
	17863
	ENSG00000118513
	ENSMUSG00000019982
	P10242; Q708E1
	P06876
NM_001130172; NM_001130173; NM_001161656; NM_001161657; NM_001161658;
	NM_001161659; NM_001161660; NM_005375
	NM_001198914; NM_010848; NM_033597
NP_001123644; NP_001123645; NP_001155128; NP_001155129; NP_001155130;
	NP_001155131; NP_001155132; NP_005366
	NP_001185843; NP_034978
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MYB (англ. MYB proto-oncogene, transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 72 341[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARRPRHSIY	SSDEDDEDFE	MCDHDYDGLL	PKSGKRHLGK	TRWTREEDEK
LKKLVEQNGT	DDWKVIANYL	PNRTDVQCQH	RWQKVLNPEL	IKGPWTKEED
QRVIELVQKY	GPKRWSVIAK	HLKGRIGKQC	RERWHNHLNP	EVKKTSWTEE
EDRIIYQAHK	RLGNRWAEIA	KLLPGRTDNA	IKNHWNSTMR	RKVEQEGYLQ
ESSKASQPAV	ATSFQKNSHL	MGFAQAPPTA	QLPATGQPTV	NNDYSYYHIS
EAQNVSSHVP	YPVALHVNIV	NVPQPAAAAI	QRHYNDEDPE	KEKRIKELEL
LLMSTENELK	GQQVLPTQNH	TCSYPGWHST	TIADHTRPHG	DSAPVSCLGE
HHSTPSLPAD	PGSLPEESAS	PARCMIVHQG	TILDNVKNLL	EFAETLQFID
SFLNTSSNHE	NSDLEMPSLT	STPLIGHKLT	VTTPFHRDQT	VKTQKENTVF
RTPAIKRSIL	ESSPRTPTPF	KHALAAQEIK	YGPLKMLPQT	PSHLVEDLQD
VIKQESDESG	IVAEFQENGP	PLLKKIKQEV	ESPTDKSGNF	FCSHHWEGDS
LNTQLFTQTS	PVADAPNILT	SSVLMAPASE	DEDNVLKAFT	VPKNRSLASP
LQPCSSTWEP	ASCGKMEEQM	TSSSQARKYV	NAFSARTLVM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Majello B., Kenyon L.C., Dalla-Favera R. (1986). Human c-myb protooncogene: nucleotide sequence of cDNA and organization of the genomic locus.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9636 — 9640. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.24.9636
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Nicolaides N.C., Gualdi R., Casadevall C., Manzella L., Calabretta B. (1991). Positive autoregulation of c-myb expression via Myb binding sites in the 5' flanking region of the human c-myb gene.. Mol. Cell. Biol. 11: 6166 — 6176. PubMed DOI:10.1128/MCB.11.12.6166
Matre V., Nordgaard O., Alm-Kristiansen A.H., Ledsaak M., Gabrielsen O.S. (2009). HIPK1 interacts with c-Myb and modulates its activity through phosphorylation.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 388: 150 — 154. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2009.07.139
Westin E.H., Gorse K.M., Clarke M.F. (1990). Alternative splicing of the human c-myb gene.. Oncogene 5: 1117 — 1124. PubMed
Jacobs S.M., Gorse K.M., Westin E.H. (1994). Identification of a second promoter in the human c-myb proto-oncogene.. Oncogene 9: 227 — 235. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з MYB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7545 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P10242 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з MYB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7545 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P10242 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.