NLRC5

NLRC5 (англ. NLR family CARD domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 866 амінокислот, а молекулярна маса — 204 595[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDPVGLQLGNKNLWSCLVRLLTKDPEWLNAKMKFFLPNTDLDSRNETLDP
EQRVILQLNKLHVQGSDTWQSFIHCVCMQLEVPLDLEVLLLSTFGYDDGF
TSQLGAEGKSQPESQLHHGLKRPHQSCGSSPRRKQCKKQQLELAKKYLQL
LRTSAQQRYRSQIPGSGQPHAFHQVYVPPILRRATASLDTPEGAIMGDVK
VEDGADVSISDLFNTRVNKGPRVTVLLGKAGMGKTTLAHRLCQKWAEGHL
NCFQALFLFEFRQLNLITRFLTPSELLFDLYLSPESDHDTVFQYLEKNAD
QVLLIFDGLDEALQPMGPDGPGPVLTLFSHLCNGTLLPGCRVMATSRPGK
LPACLPAEAAMVHMLGFDGPRVEEYVNHFFSAQPSREGALVELQTNGRLR
SLCAVPALCQVACLCLHHLLPDHAPGQSVALLPNMTQLYMQMVLALSPPG
HLPTSSLLDLGEVALRGLETGKVIFYAKDIAPPLIAFGATHSLLTSFCVC
TGPGHQQTGYAFTHLSLQEFLAALHLMASPKVNKDTLTQYVTLHSRWVQR
TKARLGLSDHLPTFLAGLASCTCRPFLSHLAQGNEDCVGAKQAAVVQVLK
KLATRKLTGPKVVELCHCVDETQEPELASLTAQSLPYQLPFHNFPLTCTD
LATLTNILEHREAPIHLDFDGCPLEPHCPEALVGCGQIENLSFKSRKCGD
AFAEALSRSLPTMGRLQMLGLAGSKITARGISHLVKALPLCPQLKEVSFR
DNQLSDQVVLNIVEVLPHLPRLRKLDLSSNSICVSTLLCLARVAVTCPTV
RMLQAREADLIFLLSPPTETTAELQRAPDLQESDGQRKGAQSRSLTLRLQ
KCQLQVHDAEALIALLQEGPHLEEVDLSGNQLEDEGCRLMAEAASQLHIA
RKLDLSNNGLSVAGVHCVLRAVSACWTLAELHISLQHKTVIFMFAQEPEE
QKGPQERAAFLDSLMLQMPSELPLSSRRMRLTHCGLQEKHLEQLCKALGG
SCHLGHLHLDFSGNALGDEGAARLAQLLPGLGALQSLNLSENGLSLDAVL
GLVRCFSTLQWLFRLDISFESQHILLRGDKTSRDMWATGSLPDFPAAAKF
LGFRQRCIPRSLCLSECPLEPPSLTRLCATLKDCPGPLELQLSCEFLSDQ
SLETLLDCLPQLPQLSLLQLSQTGLSPKSPFLLANTLSLCPRVKKVDLRS
LHHATLHFRSNEEEEGVCCGRFTGCSLSQEHVESLCWLLSKCKDLSQVDL
SANLLGDSGLRCLLECLPQVPISGLLDLSHNSISQESALYLLETLPSCPR
VREASVNLGSEQSFRIHFSREDQAGKTLRLSECSFRPEHVSRLATGLSKS
LQLTELTLTQCCLGQKQLAILLSLVGRPAGLFSLRVQEPWADRARVLSLL
EVCAQASGSVTEISISETQQQLCVQLEFPRQEENPEAVALRLAHCDLGAH
HSLLVGQLMETCARLQQLSLSQVNLCEDDDASSLLLQSLLLSLSELKTFR
LTSSCVSTEGLAHLASGLGHCHHLEELDLSNNQFDEEGTKALMRALEGKW
MLKRLDLSHLLLNSSTLALLTHRLSQMTCLQSLRLNRNSIGDVGCCHLSE
ALRAATSLEELDLSHNQIGDAGVQHLATILPGLPELRKIDLSGNSISSAG
GVQLAESLVLCRRLEELMLGCNALGDPTALGLAQELPQHLRVLHLPFSHL
GPGGALSLAQALDGSPHLEEISLAENNLAGGVLRFCMELPLLRQIDLVSC
KIDNQTAKLLTSSFTSCPALEVILLSWNLLGDEAAAELAQVLPQMGRLKR
VDLEKNQITALGAWLLAEGLAQGSSIQVIRLWNNPIPCDMAQHLKSQEPR
LDFAFFDNQPQAPWGT
NLRC5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NLRC5, CLR16.1, NOD27, NOD4, NLR family, CARD domain containing 5, NLR family CARD domain containing 5
Зовнішні ІД OMIM: 613537 MGI: 3612191 HomoloGene: 88935 GeneCards: NLRC5
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, біполярний афективний розлад[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
84166
434341
Ensembl
ENSG00000140853
ENSMUSG00000074151
UniProt
Q86WI3
C3VPR6
RefSeq (мРНК)
NM_032206
NM_001330552
NM_001033207
RefSeq (білок)
NP_001317481
NP_115582
NP_001028379
Локус (UCSC) Хр. 16: 56.99 – 57.08 Mb Хр. 8: 94.43 – 94.53 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases.. Annu. Rev. Immunol. 23: 387 — 414. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.