NOVA1

NOVA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DT4, 2ANN, 2ANR
Ідентифікатори
Символи	NOVA1, Nova-1, NOVA alternative splicing regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602157 MGI: 104297 HomoloGene: 21296 GeneCards: NOVA1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • mRNA binding; • RNA binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Ядерце; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • RNA processing; • locomotory behavior; • Сплайсинг; • regulation of RNA metabolic process; • chemical synaptic transmission; • negative regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4857
	664883
	ENSG00000139910
	ENSMUSG00000021047
	P51513
	Q9JKN6
	NM_002515; NM_006489; NM_006491
NM_021361; NM_001364634; NM_001364635; NM_001364636; NM_001364637;
	NM_001364638; NM_001364639
NP_002506; NP_006480; NP_006482; NP_001353319; NP_001353320;
	NP_001353321; NP_001353322; NP_001353323; NP_001353324; NP_001353325; NP_001353326; NP_001353327
NP_067336; NP_001351563; NP_001351564; NP_001351565; NP_001351566;
	NP_001351567; NP_001351568
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NOVA1 (англ. NOVA alternative splicing regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 52 056[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMAAAPIQQN	GTHTGVPIDL	DPPDSRKRPL	EAPPEAGSTK	RTNTGEDGQY
FLKVLIPSYA	AGSIIGKGGQ	TIVQLQKETG	ATIKLSKLSK	SKDFYPGTTE
RVCLIQGTVE	ALNAVHGFIA	EKIREMPQNV	AKTEPVSILQ	PQTTVNPDRI
KQTLPSSPTT	TKSSPSDPMT	TSRANQVKII	VPNSTAGLII	GKGGATVKAV
MEQSGAWVQL	SQKPDGINLQ	ERVVTVSGEP	EQNRKAVELI	IQKIQEDPQS
GSCLNISYAN	VTGPVANSNP	TGSPYANTAE	VLPTAAAAAG	LLGHANLAGV
AAFPAVLSGF	TGNDLVAITS	ALNTLASYGY	NLNTLGLGLS	QAAATGALAA
AAASANPAAA	AANLLATYAS	EASASGSTAG	GTAGTFALGS	LAAATAATNG
YFGAASPLAA	SAILGTEKST	DGSKDVVEIA	VPENLVGAIL	GKGGKTLVEY
QELTGARIQI	SKKGEFVPGT	RNRKVTITGT	PAATQAAQYL	ITQRITYEQG
VRAANPQKVG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Buckanovich R.J., Posner J.B., Darnell R.B. (1993). Nova, the paraneoplastic Ri antigen, is homologous to an RNA-binding protein and is specifically expressed in the developing motor system.. Neuron 11: 657 — 672. PubMed DOI:10.1016/0896-6273(93)90077-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7886 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P51513 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7886 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P51513 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.