NSD1
NSD1 (англ. Nuclear receptor binding SET domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 696 амінокислот, а молекулярна маса — 296 652[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDQTCELPRR | NCLLPFSNPV | NLDAPEDKDS | PFGNGQSNFS | EPLNGCTMQL | ||||
STVSGTSQNA | YGQDSPSCYI | PLRRLQDLAS | MINVEYLNGS | ADGSESFQDP | ||||
EKSDSRAQTP | IVCTSLSPGG | PTALAMKQEP | SCNNSPELQV | KVTKTIKNGF | ||||
LHFENFTCVD | DADVDSEMDP | EQPVTEDESI | EEIFEETQTN | ATCNYETKSE | ||||
NGVKVAMGSE | QDSTPESRHG | AVKSPFLPLA | PQTETQKNKQ | RNEVDGSNEK | ||||
AALLPAPFSL | GDTNITIEEQ | LNSINLSFQD | DPDSSTSTLG | NMLELPGTSS | ||||
SSTSQELPFC | QPKKKSTPLK | YEVGDLIWAK | FKRRPWWPCR | ICSDPLINTH | ||||
SKMKVSNRRP | YRQYYVEAFG | DPSERAWVAG | KAIVMFEGRH | QFEELPVLRR | ||||
RGKQKEKGYR | HKVPQKILSK | WEASVGLAEQ | YDVPKGSKNR | KCIPGSIKLD | ||||
SEEDMPFEDC | TNDPESEHDL | LLNGCLKSLA | FDSEHSADEK | EKPCAKSRAR | ||||
KSSDNPKRTS | VKKGHIQFEA | HKDERRGKIP | ENLGLNFISG | DISDTQASNE | ||||
LSRIANSLTG | SNTAPGSFLF | SSCGKNTAKK | EFETSNGDSL | LGLPEGALIS | ||||
KCSREKNKPQ | RSLVCGSKVK | LCYIGAGDEE | KRSDSISICT | TSDDGSSDLD | ||||
PIEHSSESDN | SVLEIPDAFD | RTENMLSMQK | NEKIKYSRFA | ATNTRVKAKQ | ||||
KPLISNSHTD | HLMGCTKSAE | PGTETSQVNL | SDLKASTLVH | KPQSDFTNDA | ||||
LSPKFNLSSS | ISSENSLIKG | GAANQALLHS | KSKQPKFRSI | KCKHKENPVM | ||||
AEPPVINEEC | SLKCCSSDTK | GSPLASISKS | GKVDGLKLLN | NMHEKTRDSS | ||||
DIETAVVKHV | LSELKELSYR | SLGEDVSDSG | TSKPSKPLLF | SSASSQNHIP | ||||
IEPDYKFSTL | LMMLKDMHDS | KTKEQRLMTA | QNLVSYRSPG | RGDCSTNSPV | ||||
GVSKVLVSGG | STHNSEKKGD | GTQNSANPSP | SGGDSALSGE | LSASLPGLLS | ||||
DKRDLPASGK | SRSDCVTRRN | CGRSKPSSKL | RDAFSAQMVK | NTVNRKALKT | ||||
ERKRKLNQLP | SVTLDAVLQG | DRERGGSLRG | GAEDPSKEDP | LQIMGHLTSE | ||||
DGDHFSDVHF | DSKVKQSDPG | KISEKGLSFE | NGKGPELDSV | MNSENDELNG | ||||
VNQVVPKKRW | QRLNQRRTKP | RKRMNRFKEK | ENSECAFRVL | LPSDPVQEGR | ||||
DEFPEHRTPS | ASILEEPLTE | QNHADCLDSA | GPRLNVCDKS | SASIGDMEKE | ||||
PGIPSLTPQA | ELPEPAVRSE | KKRLRKPSKW | LLEYTEEYDQ | IFAPKKKQKK | ||||
VQEQVHKVSS | RCEEESLLAR | GRSSAQNKQV | DENSLISTKE | EPPVLEREAP | ||||
FLEGPLAQSE | LGGGHAELPQ | LTLSVPVAPE | VSPRPALESE | ELLVKTPGNY | ||||
ESKRQRKPTK | KLLESNDLDP | GFMPKKGDLG | LSKKCYEAGH | LENGITESCA | ||||
TSYSKDFGGG | TTKIFDKPRK | RKRQRHAAAK | MQCKKVKNDD | SSKEIPGSEG | ||||
ELMPHRTATS | PKETVEEGVE | HDPGMPASKK | MQGERGGGAA | LKENVCQNCE | ||||
KLGELLLCEA | QCCGAFHLEC | LGLTEMPRGK | FICNECRTGI | HTCFVCKQSG | ||||
EDVKRCLLPL | CGKFYHEECV | QKYPPTVMQN | KGFRCSLHIC | ITCHAANPAN | ||||
VSASKGRLMR | CVRCPVAYHA | NDFCLAAGSK | ILASNSIICP | NHFTPRRGCR | ||||
NHEHVNVSWC | FVCSEGGSLL | CCDSCPAAFH | RECLNIDIPE | GNWYCNDCKA | ||||
GKKPHYREIV | WVKVGRYRWW | PAEICHPRAV | PSNIDKMRHD | VGEFPVLFFG | ||||
SNDYLWTHQA | RVFPYMEGDV | SSKDKMGKGV | DGTYKKALQE | AAARFEELKA | ||||
QKELRQLQED | RKNDKKPPPY | KHIKVNRPIG | RVQIFTADLS | EIPRCNCKAT | ||||
DENPCGIDSE | CINRMLLYEC | HPTVCPAGGR | CQNQCFSKRQ | YPEVEIFRTL | ||||
QRGWGLRTKT | DIKKGEFVNE | YVGELIDEEE | CRARIRYAQE | HDITNFYMLT | ||||
LDKDRIIDAG | PKGNYARFMN | HCCQPNCETQ | KWSVNGDTRV | GLFALSDIKA | ||||
GTELTFNYNL | ECLGNGKTVC | KCGAPNCSGF | LGVRPKNQPI | ATEEKSKKFK | ||||
KKQQGKRRTQ | GEITKEREDE | CFSCGDAGQL | VSCKKPGCPK | VYHADCLNLT | ||||
KRPAGKWECP | WHQCDICGKE | AASFCEMCPS | SFCKQHREGM | LFISKLDGRL | ||||
SCTEHDPCGP | NPLEPGEIRE | YVPPPVPLPP | GPSTHLAEQS | TGMAAQAPKM | ||||
SDKPPADTNQ | MLSLSKKALA | GTCQRPLLPE | RPLERTDSRP | QPLDKVRDLA | ||||
GSGTKSQSLV | SSQRPLDRPP | AVAGPRPQLS | DKPSPVTSPS | SSPSVRSQPL | ||||
ERPLGTADPR | LDKSIGAASP | RPQSLEKTSV | PTGLRLPPPD | RLLITSSPKP | ||||
QTSDRPTDKP | HASLSQRLPP | PEKVLSAVVQ | TLVAKEKALR | PVDQNTQSKN | ||||
RAALVMDLID | LTPRQKERAA | SPHQVTPQAD | EKMPVLESSS | WPASKGLGHM | ||||
PRAVEKGCVS | DPLQTSGKAA | APSEDPWQAV | KSLTQARLLS | QPPAKAFLYE | ||||
PTTQASGRAS | AGAEQTPGPL | SQSPGLVKQA | KQMVGGQQLP | ALAAKSGQSF | ||||
RSLGKAPASL | PTEEKKLVTT | EQSPWALGKA | SSRAGLWPIV | AGQTLAQSCW | ||||
SAGSTQTLAQ | TCWSLGRGQD | PKPEQNTLPA | LNQAPSSHKC | AESEQK |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line.. Electrophoresis 28: 2027 — 2034. PubMed DOI:10.1002/elps.200600782
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NSD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14234 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
- UniProt, Q96L73 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.