OPTC

OPTC
Ідентифікатори
Символи	OPTC, OPT, opticin
Зовнішні ІД	OMIM: 605127 MGI: 2151113 HomoloGene: 8652 GeneCards: OPTC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• extracellular region; • GO:0005578 Позаклітинна матриця;
Біологічний процес	• extracellular matrix disassembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26254
	269120
	ENSG00000188770
	ENSMUSG00000010311
	Q9UBM4
	Q920A0
	NM_014359
NM_001160420; NM_001160421; NM_001160422; NM_054076; NM_001395557;
	NM_001395558
	NP_055174
NP_001153892; NP_001153893; NP_001153894; NP_473417; NP_001382486;
	NP_001382487
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OPTC (англ. Opticin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 261[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLAFLSLL	ALVLQETGTA	SLPRKERKRR	EEQMPREGDS	FEVLPLRNDV
LNPDNYGEVI	DLSNYEELTD	YGDQLPEVKV	TSLAPATSIS	PAKSTTAPGT
PSSNPTMTRP	TTAGLLLSSQ	PNHGLPTCLV	CVCLGSSVYC	DDIDLEDIPP
LPRRTAYLYA	RFNRISRIRA	EDFKGLTKLK	RIDLSNNLIS	SIDNDAFRLL
HALQDLILPE	NQLEALPVLP	SGIEFLDVRL	NRLQSSGIQP	AAFRAMEKLQ
FLYLSDNLLD	SIPGPLPLSL	RSVHLQNNLI	ETMQRDVFCD	PEEHKHTRRQ
LEDIRLDGNP	INLSLFPSAY	FCLPRLPIGR	FT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Friedman J.S., Ducharme R., Raymond V., Walter M.A. (2000). Isolation of a novel iris-specific and leucine-rich repeat protein (oculoglycan) using differential selection.. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 41: 2059 — 2066. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q9UBM4 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UBM4 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.