PDE4B

PDE4B
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F0J, 1RO6, 1RO9, 1ROR, 1TB5, 1XLX, 1XLZ, 1XM4, 1XM6, 1XMU, 1XMY, 1XN0, 1XOS, 1XOT, 1Y2H, 1Y2J, 2CHM, 2QYL, 3D3P, 3FRG, 3G45, 3GWT, 3HC8, 3HDZ, 3HMV, 3KKT, 3LY2, 3O0J, 3O56, 3O57, 3W5E, 3WD9, 4KP6, 4MYQ, 4NW7, 4WZI, 4X0F
Ідентифікатори
Символи	PDE4B, DPDE4, PDEIVB, phosphodiesterase 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 600127 MGI: 99557 HomoloGene: 1953 GeneCards: PDE4B
Пов'язані генетичні захворювання
	lymphoblastic leukemia[1]
Реагує на сполуку
	ібуділаст, roflumilast, Роліпрам[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • hydrolase activity; • cAMP binding; • gamma-tubulin binding; • transmembrane transporter binding; • phosphoric diester hydrolase activity; • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• voltage-gated calcium channel complex; • gamma-tubulin complex; • cell periphery; • гіалоплазма; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • dendritic spine; • мембрана; • центросома; • Z disc; • excitatory synapse; • Синаптичні бульбашки;
Біологічний процес	• regulation of high voltage-gated calcium channel activity; • neutrophil homeostasis; • regulation of cardiac muscle cell contraction; • positive regulation of interferon-gamma production; • Сигнальна трансдукція; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of interleukin-2 production; • leukocyte migration; • negative regulation of relaxation of cardiac muscle; • cellular response to epinephrine stimulus; • T cell receptor signaling pathway; • neutrophil chemotaxis; • cAMP catabolic process; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5142
	18578
	ENSG00000184588
	ENSMUSG00000028525
	Q07343
	н/д
NM_001037339; NM_001037340; NM_001037341; NM_001297440; NM_001297441;
	NM_001297442; NM_002600
NM_001177980; NM_001177981; NM_001177982; NM_001177983; NM_019840;
	NM_001374780
NP_001032416; NP_001032417; NP_001032418; NP_001284369; NP_001284370;
	NP_001284371; NP_002591; NP_001032418.1; NP_002591.2
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDE4B (англ. Phosphodiesterase 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 83 343[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKSRSVMTV	MADDNVKDYF	ECSLSKSYSS	SSNTLGIDLW	RGRRCCSGNL
QLPPLSQRQS	ERARTPEGDG	ISRPTTLPLT	TLPSIAITTV	SQECFDVENG
PSPGRSPLDP	QASSSAGLVL	HATFPGHSQR	RESFLYRSDS	DYDLSPKAMS
RNSSLPSEQH	GDDLIVTPFA	QVLASLRSVR	NNFTILTNLH	GTSNKRSPAA
SQPPVSRVNP	QEESYQKLAM	ETLEELDWCL	DQLETIQTYR	SVSEMASNKF
KRMLNRELTH	LSEMSRSGNQ	VSEYISNTFL	DKQNDVEIPS	PTQKDREKKK
KQQLMTQISG	VKKLMHSSSL	NNTSISRFGV	NTENEDHLAK	ELEDLNKWGL
NIFNVAGYSH	NRPLTCIMYA	IFQERDLLKT	FRISSDTFIT	YMMTLEDHYH
SDVAYHNSLH	AADVAQSTHV	LLSTPALDAV	FTDLEILAAI	FAAAIHDVDH
PGVSNQFLIN	TNSELALMYN	DESVLENHHL	AVGFKLLQEE	HCDIFMNLTK
KQRQTLRKMV	IDMVLATDMS	KHMSLLADLK	TMVETKKVTS	SGVLLLDNYT
DRIQVLRNMV	HCADLSNPTK	SLELYRQWTD	RIMEEFFQQG	DKERERGMEI
SPMCDKHTAS	VEKSQVGFID	YIVHPLWETW	ADLVQPDAQD	ILDTLEDNRN
WYQSMIPQSP	SPPLDEQNRD	CQGLMEKFQF	ELTLDEEDSE	GPEKEGEGHS
YFSSTKTLCV	IDPENRDSLG	ETDIDIATED	KSPVDT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
McLaughlin M.M., Cieslinski L.B., Burman M., Torphy T.J., Livi G.P. (1993). A low-Km, rolipram-sensitive, cAMP-specific phosphodiesterase from human brain. Cloning and expression of cDNA, biochemical characterization of recombinant protein, and tissue distribution of mRNA.. J. Biol. Chem. 268: 6470 — 6476. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з PDE4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8781 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, Q07343 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PDE4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8781 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q07343 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.