PEX5

PEX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FCH, 2C0L, 2C0M, 2J9Q, 2W84, 3R9A, 4BXU, 4KXK, 4KYO
Ідентифікатори
Символи	PEX5, PBD2A, PBD2B, PTS1-BP, PTS1R, PXR1, RCDP5, peroxisomal biogenesis factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600414 MGI: 1098808 HomoloGene: 270 GeneCards: PEX5
Пов'язані генетичні захворювання
	rhizomelic chondrodysplasia punctata type 5, Zellweger spectrum disorder[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein C-terminus binding; • small GTPase binding; • protein N-terminus binding; • peroxisome targeting sequence binding; • enzyme binding; • GO:0001948 protein binding; • peroxisome matrix targeting signal-1 binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Пероксисома; • мембрана; • peroxisomal matrix; • внутрішньоклітинний; • комплекс Ґольджі; • гіалоплазма; • peroxisomal membrane; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of protein homotetramerization; • protein import into peroxisome membrane; • protein import into peroxisome matrix, docking; • protein tetramerization; • protein transport; • protein targeting to peroxisome; • protein import into peroxisome matrix, translocation; • protein import into peroxisome matrix; • Убіквітин-залежний протеоліз; • транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5830
	19305
	ENSG00000139197; ENSG00000288217
	ENSMUSG00000005069
	P50542
	O09012
NM_000319; NM_001131023; NM_001131024; NM_001131025; NM_001131026;
	NM_001300789; NM_001351124; NM_001351126; NM_001351127; NM_001351128; NM_001351130; NM_001351131; NM_001351132; NM_001351133; NM_001351134; NM_001351135; NM_001351136; NM_001351137; NM_001351138; NM_001351139; NM_001351140; NM_001374645; NM_001374646; NM_001374647; NM_001374648; NM_001374649
	NM_001277330; NM_001277805; NM_008995; NM_175933; NM_001360570
NP_000310; NP_001124495; NP_001124496; NP_001124497; NP_001124498;
	NP_001287718; NP_001338053; NP_001338055; NP_001338056; NP_001338057; NP_001338059; NP_001338060; NP_001338061; NP_001338062; NP_001338063; NP_001338064; NP_001338065; NP_001338066; NP_001338067; NP_001338068; NP_001338069
	NP_001264259; NP_001264734; NP_033021; NP_787947; NP_001347499
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PEX5 (англ. Peroxisomal biogenesis factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 70 865[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMRELVEAE	CGGANPLMKL	AGHFTQDKAL	RQEGLRPGPW	PPGAPASEAA
SKPLGVASED	ELVAEFLQDQ	NAPLVSRAPQ	TFKMDDLLAE	MQQIEQSNFR
QAPQRAPGVA	DLALSENWAQ	EFLAAGDAVD	VTQDYNETDW	SQEFISEVTD
PLSVSPARWA	EEYLEQSEEK	LWLGEPEGTA	TDRWYDEYHP	EEDLQHTASD
FVAKVDDPKL	ANSEFLKFVR	QIGEGQVSLE	SGAGSGRAQA	EQWAAEFIQQ
QGTSDAWVDQ	FTRPVNTSAL	DMEFERAKSA	IESDVDFWDK	LQAELEEMAK
RDAEAHPWLS	DYDDLTSATY	DKGYQFEEEN	PLRDHPQPFE	EGLRRLQEGD
LPNAVLLFEA	AVQQDPKHME	AWQYLGTTQA	ENEQELLAIS	ALRRCLELKP
DNQTALMALA	VSFTNESLQR	QACETLRDWL	RYTPAYAHLV	TPAEEGAGGA
GLGPSKRILG	SLLSDSLFLE	VKELFLAAVR	LDPTSIDPDV	QCGLGVLFNL
SGEYDKAVDC	FTAALSVRPN	DYLLWNKLGA	TLANGNQSEE	AVAAYRRALE
LQPGYIRSRY	NLGISCINLG	AHREAVEHFL	EALNMQRKSR	GPRGEGGAMS
ENIWSTLRLA	LSMLGQSDAY	GAADARDLST	LLTMFGLPQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, пероксисомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chang C.C., Warren D.S., Sacksteder K.A., Gould S.J. (1999). PEX12 interacts with PEX5 and PEX10 and acts downstream of receptor docking in peroxisomal matrix protein import.. J. Cell Biol. 147: 761 — 774. PubMed DOI:10.1083/jcb.147.4.761
Miyata N., Okumoto K., Mukai S., Noguchi M., Fujiki Y. (2012). AWP1/ZFAND6 functions in Pex5 export by interacting with cys-monoubiquitinated Pex5 and Pex6 AAA ATPase.. Traffic 13: 168 — 183. PubMed DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01298.x
Gatto G.J. Jr., Geisbrecht B.V., Gould S.J., Berg J.M. (2000). Peroxisomal targeting signal-1 recognition by the TPR domains of human PEX5.. Nat. Struct. Biol. 7: 1091 — 1095. PubMed DOI:10.1038/81930

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з PEX5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9719 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P50542 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PEX5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9719 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P50542 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.