PODXL

PODXL
Ідентифікатори
Символи	PODXL, Gp200, PC, PCLP, PCLP-1, podocalyxin like, PODXL1, PDX, gp135
Зовнішні ІД	OMIM: 602632 HomoloGene: 136790 GeneCards: PODXL
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell body; • integral component of membrane; • cell projection; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • filopodium; • ruffle; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • Мікроворсинки; • slit diaphragm; • apical plasma membrane; • membrane raft; • Екзосома; • microvillus membrane; • lamellipodium; • extracellular space; • Ядерце; • Центр організації мікротрубочок;
Біологічний процес	• regulation of microvillus assembly; • negative regulation of cell adhesion; • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin; • glomerular visceral epithelial cell development; • negative regulation of cell-cell adhesion; • positive regulation of cell migration; • Адгезія клітин; • regulation of cell-cell adhesion; • cell migration; • leukocyte migration; • epithelial tube formation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5420
	н/д
	ENSG00000128567
	н/д
	O00592
	н/д
	NM_005397; NM_001018111
	н/д
	NP_001018121; NP_005388
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

PODXL (англ. Podocalyxin like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 558 амінокислот, а молекулярна маса — 58 635[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRCALALSAL	LLLLSTPPLL	PSSPSPSPSP	SQNATQTTTD	SSNKTAPTPA
SSVTIMATDT	AQQSTVPTSK	ANEILASVKA	TTLGVSSDSP	GTTTLAQQVS
GPVNTTVARG	GGSGNPTTTI	ESPKSTKSAD	TTTVATSTAT	AKPNTTSSQN
GAEDTTNSGG	KSSHSVTTDL	TSTKAEHLTT	PHPTSPLSPR	QPTSTHPVAT
PTSSGHDHLM	KISSSSSTVA	IPGYTFTSPG	MTTTLLETVF	HHVSQAGLEL
LTSGDLPTLA	SQSAGITASS	VISQRTQQTS	SQMPASSTAP	SSQETVQPTS
PATALRTPTL	PETMSSSPTA	ASTTHRYPKT	PSPTVAHESN	WAKCEDLETQ
TQSEKQLVLN	LTGNTLCAGG	ASDEKLISLI	CRAVKATFNP	AQDKCGIRLA
SVPGSQTVVV	KEITIHTKLP	AKDVYERLKD	KWDELKEAGV	SDMKLGDQGP
PEEAEDRFSM	PLIITIVCMA	SFLLLVAALY	GCCHQRLSQR	KDQQRLTEEL
QTVENGYHDN	PTLEVMETSS	EMQEKKVVSL	NGELGDSWIV	PLDNLTKDDL
DEEEDTHL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Schopperle W.M., Kershaw D.B., DeWolf W.C. (2003). Human embryonal carcinoma tumor antigen, Gp200/GCTM-2, is podocalyxin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 285 — 290. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(02)02844-9
Sizemore S., Cicek M., Sizemore N., Ng K.P., Casey G. (2007). Podocalyxin increases the aggressive phenotype of breast and prostate cancer cells in vitro through its interaction with ezrin.. Cancer Res. 67: 6183 — 6191. PubMed DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-3575

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9171 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, O00592 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9171 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-3] UniProt, O00592 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.