POLR2B

POLR2B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2B, POL2RB, RPB2, hRPB140, hsRPB2, polymerase (RNA) II subunit B, RNA polymerase II subunit B
Зовнішні ІД	OMIM: 180661 MGI: 2388280 HomoloGene: 722 GeneCards: POLR2B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • ribonucleoside binding; • RNA polymerase II activity; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • somatic stem cell population maintenance; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of viral transcription; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5431
	231329
	ENSG00000047315
	ENSMUSG00000029250
	P30876
	Q8CFI7
	NM_001303269; NM_000938; NM_001303268
	NM_153798
	NP_000929; NP_001290197; NP_001290198
	NP_722493
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2B (англ. RNA polymerase II subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 174 амінокислот, а молекулярна маса — 133 897[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYDADEDMQY	DEDDDEITPD	LWQEACWIVI	SSYFDEKGLV	RQQLDSFDEF
IQMSVQRIVE	DAPPIDLQAE	AQHASGEVEE	PPRYLLKFEQ	IYLSKPTHWE
RDGAPSPMMP	NEARLRNLTY	SAPLYVDITK	TVIKEGEEQL	QTQHQKTFIG
KIPIMLRSTY	CLLNGLTDRD	LCELNECPLD	PGGYFIINGS	EKVLIAQEKM
ATNTVYVFAK	KDSKYAYTGE	CRSCLENSSR	PTSTIWVSML	ARGGQGAKKS
AIGQRIVATL	PYIKQEVPII	IVFRALGFVS	DRDILEHIIY	DFEDPEMMEM
VKPSLDEAFV	IQEQNVALNF	IGSRGAKPGV	TKEKRIKYAK	EVLQKEMLPH
VGVSDFCETK	KAYFLGYMVH	RLLLAALGRR	ELDDRDHYGN	KRLDLAGPLL
AFLFRGMFKN	LLKEVRIYAQ	KFIDRGKDFN	LELAIKTRII	SDGLKYSLAT
GNWGDQKKAH	QARAGVSQVL	NRLTFASTLS	HLRRLNSPIG	RDGKLAKPRQ
LHNTLWGMVC	PAETPEGHAV	GLVKNLALMA	YISVGSQPSP	ILEFLEEWSM
ENLEEISPAA	IADATKIFVN	GCWVGIHKDP	EQLMNTLRKL	RRQMDIIVSE
VSMIRDIRER	EIRIYTDAGR	ICRPLLIVEK	QKLLLKKRHI	DQLKEREYNN
YSWQDLVASG	VVEYIDTLEE	ETVMLAMTPD	DLQEKEVAYC	STYTHCEIHP
SMILGVCASI	IPFPDHNQSP	RNTYQSAMGK	QAMGVYITNF	HVRMDTLAHV
LYYPQKPLVT	TRSMEYLRFR	ELPAGINSIV	AIASYTGYNQ	EDSVIMNRSA
VDRGFFRSVF	YRSYKEQESK	KGFDQEEVFE	KPTRETCQGM	RHAIYDKLDD
DGLIAPGVRV	SGDDVIIGKT	VTLPENEDEL	ESTNRRYTKR	DCSTFLRTSE
TGIVDQVMVT	LNQEGYKFCK	IRVRSVRIPQ	IGDKFASRHG	QKGTCGIQYR
QEDMPFTCEG	ITPDIIINPH	AIPSRMTIGH	LIECLQGKVS	ANKGEIGDAT
PFNDAVNVQK	ISNLLSDYGY	HLRGNEVLYN	GFTGRKITSQ	IFIGPTYYQR
LKHMVDDKIH	SRARGPIQIL	NRQPMEGRSR	DGGLRFGEME	RDCQIAHGAA
QFLRERLFEA	SDPYQVHVCN	LCGIMAIANT	RTHTYECRGC	RNKTQISLVR
MPYACKLLFQ	ELMSMSIAPR	MMSV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як транскрипція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Primary structure of the second largest subunit of human RNA polymerase II (or B).. J. Mol. Biol. 226: 1295 — 1299. PubMed DOI:10.1016/0022-2836(92)91071-V
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes.. Mol. Cell. Biol. 28: 609 — 618. PubMed DOI:10.1128/MCB.01356-07

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9188 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P30876 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9188 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P30876 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.