POLR2C

POLR2C
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5IYC, 5IY6, 5IYD, 5IY8, 5IY7, 5IY9, 5IYA, 5IYB,%%s5IYD, 5IY8, 5IYC, 5IY6, 5IY7, 5IYA, 5IY9, 5IYB
Ідентифікатори
Символи	POLR2C, RPB3, RPB31, hRPB33, hsRPB3, polymerase (RNA) II subunit C, RNA polymerase II subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 180663 MGI: 109299 HomoloGene: 2017 GeneCards: POLR2C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein dimerization activity; • RNA polymerase II activity; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• microtubule cytoskeleton; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA; • transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5432
	20021
	ENSG00000102978
	ENSMUSG00000031783
	P19387; Q6FGR6
	P97760
	NM_002694; NM_032940
	NM_009090
	NP_116558; NP_116558.1
	NP_033116
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2C (англ. RNA polymerase II subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 31 441[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPYANQPTVR	ITELTDENVK	FIIENTDLAV	ANSIRRVFIA	EVPIIAIDWV
QIDANSSVLH	DEFIAHRLGL	IPLISDDIVD	KLQYSRDCTC	EEFCPECSVE
FTLDVRCNED	QTRHVTSRDL	ISNSPRVIPV	TSRNRDNDPN	DYVEQDDILI
VKLRKGQELR	LRAYAKKGFG	KEHAKWNPTA	GVAFEYDPDN	ALRHTVYPKP
EEWPKSEYSE	LDEDESQAPY	DPNGKPERFY	YNVESCGSLR	PETIVLSALS
GLKKKLSDLQ	TQLSHEIQSD	VLTIN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як транскрипція. Локалізований у ядрі.

Література

Dammann R., Pfeifer G.P. (1998). Cloning and characterization of the human RNA polymerase I subunit hRPA40.. Biochim. Biophys. Acta 1396: 153 — 157. PubMed DOI:10.1016/S0167-4781(97)00206-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Pati U.K., Weissman S.M. (1990). The amino acid sequence of the human RNA polymerase II 33-kDa subunit hRPB 33 is highly conserved among eukaryotes.. J. Biol. Chem. 265: 8400 — 8403. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9189 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P19387 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9189 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P19387 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.