POLR2D

POLR2D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2C35, 5IYD, 5IY8, 5IYC, 5IY6, 5IY7, 5IYA, 5IY9, 5IYB
Ідентифікатори
Символи	POLR2D, HSRBP4, HSRPB4, RBP4, RPB16, RNA polymerase II subunit B4, polymerase (RNA) II subunit D, RNA polymerase II subunit D, RPB4
Зовнішні ІД	OMIM: 606017 MGI: 1916491 HomoloGene: 37968 GeneCards: POLR2D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • single-stranded DNA binding; • каталітична активність; • single-stranded RNA binding; • translation initiation factor binding;
Клітинна компонента	• P-body; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck; • nuclear DNA-directed RNA polymerase complex; • RNA polymerase complex;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • recruitment of 3'-end processing factors to RNA polymerase II holoenzyme complex; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • cell metabolism; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of translational initiation; • mRNA export from nucleus in response to heat stress; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA; • DNA-templated transcription, initiation; • transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5433
	69241
	ENSG00000144231
	ENSMUSG00000024258
	O15514
	Q9D7M8
	NM_004805
	NM_027002; NM_001357480
	NP_004796
	NP_081278; NP_001344409
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2D (англ. RNA polymerase II subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 311[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGGSDPRA	GDVEEDASQL	IFPKEFETAE	TLLNSEVHML	LEHRKQQNES
AEDEQELSEV	FMKTLNYTAR	FSRFKNRETI	ASVRSLLLQK	KLHKFELACL
ANLCPETAEE	SKALIPSLEG	RFEDEELQQI	LDDIQTKRSF	QY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як транскрипція. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Meka H., Werner F., Cordell S.C., Onesti S., Brick P. (2005). Crystal structure and RNA binding of the Rpb4/Rpb7 subunits of human RNA polymerase II.. Nucleic Acids Res. 33: 6435 — 6444. PubMed DOI:10.1093/nar/gki945

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9191 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, O15514 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9191 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O15514 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.