POLR2J

POLR2J
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2J, POLR2J1, RPB11, RPB11A, RPB11m, hRPB14, polymerase (RNA) II subunit J, RNA polymerase II subunit J
Зовнішні ІД	OMIM: 604150 MGI: 109582 HomoloGene: 4542 GeneCards: POLR2J
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • LRR domain binding; • protein dimerization activity; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA polymerase II activity;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • РНК-полімераза II;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5439
	20022
	ENSG00000005075
	ENSMUSG00000039771
	P52435
	O08740
	NM_006234; NM_001371100; NM_001393919
	NM_011293
	NP_006225; NP_001358029
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2J (англ. RNA polymerase II subunit J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 293[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNAPPAFESF	LLFEGEKKIT	INKDTKVPNA	CLFTINKEDH	TLGNIIKSQL
LKDPQVLFAG	YKVPHPLEHK	IIIRVQTTPD	YSPQEAFTNA	ITDLISELSL
LEERFRVAIK	DKQEGIE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9197 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P52435 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9197 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P52435 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.