POU5F1

POU5F1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OCP, 3L1P
Ідентифікатори
Символи	POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
Пов'язані генетичні захворювання
	синдром Стівенса — Джонсона[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • miRNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • ubiquitin protein ligase binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • transcription regulator complex; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • мітохондрія;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • negative regulation of gene silencing by miRNA; • cell fate commitment involved in formation of primary germ layer; • endodermal cell fate specification; • anatomical structure morphogenesis; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of asymmetric cell division; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • multicellular organism development; • cardiac cell fate determination; • response to wounding; • BMP signaling pathway involved in heart induction; • Регуляція експресії генів; • regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway; • blastocyst development; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of SMAD protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5460
	18999
ENSG00000230336; ENSG00000206454; ENSG00000204531; ENSG00000237582; ENSG00000229094;
	ENSG00000233911; ENSG00000235068
	ENSMUSG00000024406
	Q01860
	P20263
	NM_203289; NM_001173531; NM_001285986; NM_001285987; NM_002701
	NM_001252452; NM_013633
NP_001167002; NP_001272915; NP_001272916; NP_002692; NP_976034;
	NP_001272915.1
	NP_001239381; NP_038661
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1), більш відомий як Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 38 571[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGHLASDFA	FSPPPGGGGD	GPGGPEPGWV	DPRTWLSFQG	PPGGPGIGPG
VGPGSEVWGI	PPCPPPYEFC	GGMAYCGPQV	GVGLVPQGGL	ETSQPEGEAG
VGVESNSDGA	SPEPCTVTPG	AVKLEKEKLE	QNPEESQDIK	ALQKELEQFA
KLLKQKRITL	GYTQADVGLT	LGVLFGKVFS	QTTICRFEAL	QLSFKNMCKL
RPLLQKWVEE	ADNNENLQEI	CKAETLVQAR	KRKRTSIENR	VRGNLENLFL
QCPKPTLQQI	SHIAQQLGLE	KDVVRVWFCN	RRQKGKRSSS	DYAQREDFEA
AGSPFSGGPV	SFPLAPGPHF	GTPGYGSPHF	TALYSSVPFP	EGEAFPPVSV
TTLGSPMHSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Takeda J., Seino S., Bell G.I. (1992). Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues.. Nucleic Acids Res. 20: 4613 — 4620. PubMed DOI:10.1093/nar/20.17.4613
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wey E., Lyons G.E., Schaefer B.W. (1994). A human POU domain gene, mPOU, is expressed in developing brain and specific adult tissues.. Eur. J. Biochem. 220: 753 — 762. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1994.tb18676.x
Abdel-Rahman B., Fiddler M., Rappolee D., Pergament E. (1995). Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos.. Hum. Reprod. 10: 2787 — 2792. PubMed DOI:10.1093/oxfordjournals.humrep.a135792
Lee J., Kim H.K., Han Y.-M., Kim J. (2008). Pyruvate kinase isozyme type M2 (PKM2) interacts and cooperates with Oct-4 in regulating transcription.. Int. J. Biochem. Cell Biol. 40: 1043 — 1054. PubMed DOI:10.1016/j.biocel.2007.11.009
Spelat R., Ferro F., Curcio F. (2012). Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation.. J. Biol. Chem. 287: 38279 — 38288. PubMed DOI:10.1074/jbc.M112.386755

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з POU5F1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9221 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q01860 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з POU5F1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9221 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q01860 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.