PTK7

PTK7
Ідентифікатори
Символи	PTK7, CCK-4, CCK4, protein tyrosine kinase 7 (inactive)
Зовнішні ІД	OMIM: 601890 MGI: 1918711 HomoloGene: 43672 GeneCards: PTK7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization; • cellular response to retinoic acid; • ventricular septum development; • convergent extension; • establishment of planar polarity; • Загоєння ран; • Wnt signaling pathway; • coronary vasculature development; • planar cell polarity pathway involved in neural tube closure; • protein phosphorylation; • heart development; • establishment of epithelial cell apical/basal polarity; • Адгезія клітин; • neural tube closure; • axis elongation; • cochlea morphogenesis; • positive regulation of neuron projection development; • canonical Wnt signaling pathway; • lung-associated mesenchyme development; • cell migration; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5754
	71461
	ENSG00000112655
	ENSMUSG00000023972
	Q13308
	Q8BKG3
NM_001270398; NM_002821; NM_152880; NM_152881; NM_152882;
	NM_152883
	NM_175168
	NP_001257327; NP_002812; NP_690619; NP_690620; NP_690621
	NP_780377
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTK7 (англ. Protein tyrosine kinase 7 (inactive)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 070 амінокислот, а молекулярна маса — 118 392[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAARGSPAR	PRRLPLLSVL	LLPLLGGTQT	AIVFIKQPSS	QDALQGRRAL
LRCEVEAPGP	VHVYWLLDGA	PVQDTERRFA	QGSSLSFAAV	DRLQDSGTFQ
CVARDDVTGE	EARSANASFN	IKWIEAGPVV	LKHPASEAEI	QPQTQVTLRC
HIDGHPRPTY	QWFRDGTPLS	DGQSNHTVSS	KERNLTLRPA	GPEHSGLYSC
CAHSAFGQAC	SSQNFTLSIA	DESFARVVLA	PQDVVVARYE	EAMFHCQFSA
QPPPSLQWLF	EDETPITNRS	RPPHLRRATV	FANGSLLLTQ	VRPRNAGIYR
CIGQGQRGPP	IILEATLHLA	EIEDMPLFEP	RVFTAGSEER	VTCLPPKGLP
EPSVWWEHAG	VRLPTHGRVY	QKGHELVLAN	IAESDAGVYT	CHAANLAGQR
RQDVNITVAT	VPSWLKKPQD	SQLEEGKPGY	LDCLTQATPK	PTVVWYRNQM
LISEDSRFEV	FKNGTLRINS	VEVYDGTWYR	CMSSTPAGSI	EAQARVQVLE
KLKFTPPPQP	QQCMEFDKEA	TVPCSATGRE	KPTIKWERAD	GSSLPEWVTD
NAGTLHFARV	TRDDAGNYTC	IASNGPQGQI	RAHVQLTVAV	FITFKVEPER
TTVYQGHTAL	LQCEAQGDPK	PLIQWKGKDR	ILDPTKLGPR	MHIFQNGSLV
IHDVAPEDSG	RYTCIAGNSC	NIKHTEAPLY	VVDKPVPEES	EGPGSPPPYK
MIQTIGLSVG	AAVAYIIAVL	GLMFYCKKRC	KAKRLQKQPE	GEEPEMECLN
GGPLQNGQPS	AEIQEEVALT	SLGSGPAATN	KRHSTSDKMH	FPRSSLQPIT
TLGKSEFGEV	FLAKAQGLEE	GVAETLVLVK	SLQSKDEQQQ	LDFRRELEMF
GKLNHANVVR	LLGLCREAEP	HYMVLEYVDL	GDLKQFLRIS	KSKDEKLKSQ
PLSTKQKVAL	CTQVALGMEH	LSNNRFVHKD	LAARNCLVSA	QRQVKVSALG
LSKDVYNSEY	YHFRQAWVPL	RWMSPEAILE	GDFSTKSDVW	AFGVLMWEVF
THGEMPHGGQ	ADDEVLADLQ	AGKARLPQPE	GCPSKLYRLM	QRCWALSPKD
RPSFSEIASA	LGDSTVDSKP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

Park S.-K., Lee H.-S., Lee S.-T. (1996). Characterization of the human full-length PTK7 cDNA encoding a receptor protein tyrosine kinase-like molecule closely related to chick KLG.. J. Biochem. 119: 235 — 239. PubMed DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021228
Jung J.-W., Ji A.-R., Lee J., Kim U.-J., Lee S.-T. (2002). Organization of the human PTK7 gene encoding a receptor protein tyrosine kinase-like molecule and alternative splicing of its mRNA.. Biochim. Biophys. Acta 1579: 153 — 163. PubMed DOI:10.1016/S0167-4781(02)00536-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9618 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q13308 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9618 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13308 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.