QKI

QKI
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4JVH
Ідентифікатори
Символи	QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, KH domain containing, RNA binding, KH domain containing RNA binding
Зовнішні ІД	OMIM: 609590 MGI: 97837 HomoloGene: 11059 GeneCards: QKI
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • mRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • синапс;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • mRNA transport; • mRNA processing; • васкулогенез; • multicellular organism development; • axon ensheathment; • muscle cell differentiation; • positive regulation of gene expression; • long-chain fatty acid biosynthetic process; • Сплайсинг; • spermatid development; • myelination; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • regulation of translation; • транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9444
	19317
	ENSG00000112531
	ENSMUSG00000062078
	Q96PU8
	Q9QYS9
	NM_001301085; NM_006775; NM_206853; NM_206854; NM_206855
	NM_001159516; NM_001159517; NM_021881
	NP_001288014; NP_006766; NP_996735; NP_996736; NP_996737
	NP_001152988; NP_001152989; NP_068681
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

QKI (англ. QKI, KH domain containing RNA binding) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 671[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVGEMETKEK	PKPTPDYLMQ	LMNDKKLMSS	LPNFCGIFNH	LERLLDEEIS
RVRKDMYNDT	LNGSTEKRSA	ELPDAVGPIV	QLQEKLYVPV	KEYPDFNFVG
RILGPRGLTA	KQLEAETGCK	IMVRGKGSMR	DKKKEEQNRG	KPNWEHLNED
LHVLITVEDA	QNRAEIKLKR	AVEEVKKLLV	PAAEGEDSLK	KMQLMELAIL
NGTYRDANIK	SPALAFSLAA	TAQAAPRIIT	GPAPVLPPAA	LRTPTPAGPT
IMPLIRQIQT	AVMPNGTPHP	TAAIVPPGPE	AGLIYTPYEY	PYTLAPATSI
LEYPIEPSGV	LGAVATKVRR	HDMRVHPYQR	IVTADRAATG	N

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1.. Mol. Biol. Cell 14: 274 — 287. PubMed DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484
Aberg K., Saetre P., Jareborg N., Jazin E. (2006). Human QKI, a potential regulator of mRNA expression of human oligodendrocyte-related genes involved in schizophrenia.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 7482 — 7487. PubMed DOI:10.1073/pnas.0601213103

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21100 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q96PU8 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21100 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96PU8 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.