RCOR1

RCOR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2IW5, 2UXN, 2UXX, 2V1D, 2X0L, 2XAF, 2XAG, 2XAH, 2XAJ, 2XAQ, 2XAS, 2Y48, 3ZMS, 3ZMT, 3ZMU, 3ZMV, 3ZMZ, 3ZN0, 3ZN1, 4BAY, 4KUM, 4UV8, 4UV9, 4UVA, 4UVB, 4UVC, 4UXN, 5L3D, 5L3B, 5L3C, 4XBF
Ідентифікатори
Символи	RCOR1, COREST, RCOR, REST corepressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607675 MGI: 106340 HomoloGene: 32246 GeneCards: RCOR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948 protein binding; • transcription factor binding; • histone deacetylase activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity;
Клітинна компонента	• DNA repair complex; • transcription repressor complex; • клітинне ядро; • transcription regulator complex; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• histone H4 deacetylation; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • зсідання крові; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • chromatin organization; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23186
	217864
	ENSG00000089902
	ENSMUSG00000037896
	Q9UKL0
	Q8CFE3
	NM_015156
	NM_198023
	NP_055971
	NP_932140
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RCOR1 (англ. REST corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 53 327[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAMVEKGPE	VSGKRRGRNN	AAASASAAAA	SAAASAACAS	PAATAASGAA
ASSASAAAAS	AAAAPNNGQN	KSLAAAAPNG	NSSSNSWEEG	SSGSSSDEEH
GGGGMRVGPQ	YQAVVPDFDP	AKLARRSQER	DNLGMLVWSP	NQNLSEAKLD
EYIAIAKEKH	GYNMEQALGM	LFWHKHNIEK	SLADLPNFTP	FPDEWTVEDK
VLFEQAFSFH	GKTFHRIQQM	LPDKSIASLV	KFYYSWKKTR	TKTSVMDRHA
RKQKREREES	EDELEEANGN	NPIDIEVDQN	KESKKEVPPT	ETVPQVKKEK
HSTQAKNRAK	RKPPKGMFLS	QEDVEAVSAN	ATAATTVLRQ	LDMELVSVKR
QIQNIKQTNS	ALKEKLDGGI	EPYRLPEVIQ	KCNARWTTEE	QLLAVQAIRK
YGRDFQAISD	VIGNKSVVQV	KNFFVNYRRR	FNIDEVLQEW	EAEHGKEETN
GPSNQKPVKS	PDNSIKMPEE	EDEAPVLDVR	YASAS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. (2001). CoREST is an integral component of the CoREST-human histone deacetylase complex.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1454 — 1458. PubMed DOI:10.1073/pnas.98.4.1454
Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes.. J. Biol. Chem. 278: 7234 — 7239. PubMed DOI:10.1074/jbc.M208992200
Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation.. Nature 437: 432 — 435. PubMed DOI:10.1038/nature04021
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. (2005). Components of the REST/CoREST/histone deacetylase repressor complex are disrupted, modified, and translocated in HSV-1-infected cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 7571 — 7576. PubMed DOI:10.1073/pnas.0502658102

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17441 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9UKL0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17441 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UKL0 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.