RIPK3

RIPK3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4M66, 4M69
Ідентифікатори
Символи	RIPK3, RIP3, receptor interacting serine/threonine kinase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605817 MGI: 2154952 HomoloGene: 31410 GeneCards: RIPK3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • NF-kappaB-inducing kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • ATP binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • мітохондрія;
Біологічний процес	• regulation of CD8-positive, alpha-beta cytotoxic T cell extravasation; • amyloid fibril formation; • T cell differentiation in thymus; • protein heterooligomerization; • фосфорилювання; • thymus development; • regulation of interferon-gamma production; • positive regulation of oxidoreductase activity; • regulation of adaptive immune response; • spleen development; • regulation of reactive oxygen species metabolic process; • regulation of activation-induced cell death of T cells; • T cell homeostasis; • positive regulation of phosphatase activity; • positive regulation of necroptotic process; • protein phosphorylation; • regulation of activated T cell proliferation; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; • cellular protein modification process; • NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • apoptotic signaling pathway; • protein autophosphorylation; • positive regulation of ligase activity; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • regulation of T cell mediated cytotoxicity; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • lymph node development; • protein homooligomerization; • activation of protein kinase activity; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • запрограмована клітинна смерть; • positive regulation of necrotic cell death; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription; • cellular response to hydrogen peroxide; • programmed necrotic cell death;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	11035
	56532
	ENSG00000129465; ENSG00000285379
	ENSMUSG00000022221
	Q9Y572
	Q9QZL0
	NM_006871
	NM_001164107; NM_001164108; NM_019955
	NP_006862
	NP_001157579; NP_001157580; NP_064339
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RIPK3 (англ. Receptor interacting serine/threonine kinase 3) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 56 887[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSCVKLWPSG	APAPLVSIEE	LENQELVGKG	GFGTVFRAQH	RKWGYDVAVK
IVNSKAISRE	VKAMASLDNE	FVLRLEGVIE	KVNWDQDPKP	ALVTKFMENG
SLSGLLQSQC	PRPWPLLCRL	LKEVVLGMFY	LHDQNPVLLH	RDLKPSNVLL
DPELHVKLAD	FGLSTFQGGS	QSGTGSGEPG	GTLGYLAPEL	FVNVNRKAST
ASDVYSFGIL	MWAVLAGREV	ELPTEPSLVY	EAVCNRQNRP	SLAELPQAGP
ETPGLEGLKE	LMQLCWSSEP	KDRPSFQECL	PKTDEVFQMV	ENNMNAAVST
VKDFLSQLRS	SNRRFSIPES	GQGGTEMDGF	RRTIENQHSR	NDVMVSEWLN
KLNLEEPPSS	VPKKCPSLTK	RSRAQEEQVP	QAWTAGTSSD	SMAQPPQTPE
TSTFRNQMPS	PTSTGTPSPG	PRGNQGAERQ	GMNWSCRTPE	PNPVTGRPLV
NIYNCSGVQV	GDNNYLTMQQ	TTALPTWGLA	PSGKGRGLQH	PPPVGSQEGP
KDPEAWSRPQ	GWYNHSGK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, мітохондрії.

Див. також

Хромосома 14

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10021 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9Y572 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Література

Yang Y., Hu W., Feng S., Ma J., Wu M. (2005). RIP3 beta and RIP3 gamma, two novel splice variants of receptor-interacting protein 3 (RIP3), downregulate RIP3-induced apoptosis.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332: 181 — 187. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.114
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Sun X., Yin J., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2002). Identification of a novel homotypic interaction motif required for the phosphorylation of receptor-interacting protein (RIP) by RIP3.. J. Biol. Chem. 277: 9505 — 9511. PubMed DOI:10.1074/jbc.M109488200
Vandenabeele P., Declercq W., Van Herreweghe F., Vanden Berghe T. (2010). The role of the kinases RIP1 and RIP3 in TNF-induced necrosis.. Sci. Signal. 3: RE4 — RE4. PubMed DOI:10.1126/scisignal.3115re4
Wang Z., Jiang H., Chen S., Du F., Wang X. (2012). The mitochondrial phosphatase PGAM5 functions at the convergence point of multiple necrotic death pathways.. Cell 148: 228 — 243. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2011.11.030

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10021 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y572 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.