RNF128

RNF128
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3ICU
Ідентифікатори
Символи	RNF128, GRAIL, ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase, ring finger protein 128
Зовнішні ІД	OMIM: 300439 MGI: 1914139 HomoloGene: 11337 GeneCards: RNF128
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • transferase activity;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • endomembrane system; • late endosome; • мембрана; • цитоплазма; • integral component of membrane; • Цитоскелет; • Ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of protein catabolic process in the vacuole; • Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of protein stability; • protein localization to lysosome; • protein deubiquitination; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79589
	66889
	ENSG00000133135
	ENSMUSG00000031438
	Q8TEB7
	Q9D304
	NM_194463; NM_024539
	NM_001254761; NM_023270
	NP_078815; NP_919445
	NP_001241690; NP_075759
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF128 (англ. Ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 46 521[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPPPGAGVS	CRGGCGFSRL	LAWCFLLALS	PQAPGSRGAE	AVWTAYLNVS
WRVPHTGVNR	TVWELSEEGV	YGQDSPLEPV	AGVLVPPDGP	GALNACNPHT
NFTVPTVWGS	TVQVSWLALI	QRGGGCTFAD	KIHLAYERGA	SGAVIFNFPG
TRNEVIPMSH	PGAVDIVAIM	IGNLKGTKIL	QSIQRGIQVT	MVIEVGKKHG
PWVNHYSIFF	VSVSFFIITA	ATVGYFIFYS	ARRLRNARAQ	SRKQRQLKAD
AKKAIGRLQL	RTLKQGDKEI	GPDGDSCAVC	IELYKPNDLV	RILTCNHIFH
KTCVDPWLLE	HRTCPMCKCD	ILKALGIEVD	VEDGSVSLQV	PVSNEISNSA
SSHEEDNRSE	TASSGYASVQ	GTDEPPLEEH	VQSTNESLQL	VNHEANSVAV
DVIPHVDNPT	FEEDETPNQE	TAVREIKS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ichikawa D., Mizuno M., Yamamura T., Miyake S. (2011). GRAIL (gene related to anergy in lymphocytes) regulates cytoskeletal reorganization through ubiquitination and degradation of Arp2/3 subunit 5 and coronin 1A.. J. Biol. Chem. 286: 43465 — 43474. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.222711

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21153 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.
UniProt, Q8TEB7 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21153 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8TEB7 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.